RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 GGT5P36269 586 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CD86P42081 329 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TTPAP49638 278 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 GSK3BP49841 420 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ENTPD1P49961 510 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 STC1P52823 247 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 PLK1P53350 603 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ARSFP54793 590 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TAS2R50P59544 299 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TLE3Q04726 772 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ACVR1Q04771 509 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 LIPEQ05469 1076 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 IL10RBQ08334 325 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DNASE1L3Q13609 305 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ITGA7Q13683 1181 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CAMK1Q14012 370 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RCAN2Q14206 197 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 GK3PQ14409 553 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 GRB14Q14449 540 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ZNF235Q14590 738 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 NR1D2Q14995 579 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RBBP7Q16576 425 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DGUOKQ16854 277 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TRIM16LQ309B1 348 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 UGT3A2Q3SY77 523 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 LY6G5CQ5SRR4 150 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ABHD17BQ5VST6 288 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 GPR107Q5VW38 600 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CLEC6AQ6EIG7 209 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 GLYATQ6IB77 296 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 FAM171BQ6P995 826 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 MON1AQ86VX9 555 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 EID3Q8N140 333 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DPP10Q8N608 796 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TEX26Q8N6G2 289 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 OR52E4Q8NGH9 312 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 OR13F1Q8NGS4 319 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 OR4L1Q8NH43 312 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 HMGCLL1Q8TB92 370 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ITFG1Q8TB96 612 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 PROKR1Q8TCW9 393 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 SLC2A12Q8TD20 617 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 BRSK1Q8TDC3 778 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 GLMPQ8WWB7 406 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 EXT2Q93063 718 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TMIGD2Q96BF3 282 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 PPP3R2Q96LZ3 170 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RNF145Q96MT1 663 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CCDC115Q96NT0 180 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ZNF347Q96SE7 839 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 FEM1AQ9BSK4 669 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CHID1Q9BWS9 393 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 IL21RQ9HBE5 538 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 NT5MQ9NPB1 228 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TMEM248Q9NWD8 314 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CMTM6Q9NX76 183 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 SCN3BQ9NY72 215 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 NUDT4Q9NZJ9 180 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DNAJB9Q9UBS3 223 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ZNF639Q9UID6 485 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 SLC25A13Q9UJS0 675 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 CAMK2AQ9UQM7 478 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 RCE1Q9Y256 329 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TPRKBQ9Y3C4 175 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ZNF711Q9Y462 761 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 TRPV2Q9Y5S1 764 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 MCM3APO60318 1980 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 SHROOM3Q8TF72 1996 aa4.19□□□□□ -1.74
USP25-210ENST00000549362 EP400Q96L91 3159 aa4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms