RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 RAB26Q9ULW5 256 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.26□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 TXNDC9O14530 226 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ACOX3O15254 700 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CLOCKO15516 846 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 P2RX6O15547 441 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DENRO43583 198 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 B3GALT2O43825 422 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 AIFM1O95831 613 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SERPINA1P01009 418 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 NTRK1P04629 796 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PROS1P07225 676 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 NUDT7P0C024 238 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PVRP15151 417 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 TYRP1P17643 537 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ALOX12P18054 663 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CERS1P27544 350 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CRATP43155 626 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CTSKP43235 329 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 EPHA4P54764 986 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 AQP4P55087 323 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 NKG7Q16617 165 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 FRMPD2BQ6IN97 320 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SLC48A1Q6P1K1 146 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ENPP6Q6UWR7 440 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CBLL1Q75N03 491 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CCDC80Q76M96 950 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ABHD13Q7L211 337 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SLC30A8Q8IWU4 369 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DNAJC22Q8N4W6 341 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 FBXO30Q8TB52 745 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 EDAQ92838 391 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 UCN3Q969E3 161 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 TCTN2Q96GX1 697 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZNF597Q96LX8 424 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 AMDHD1Q96NU7 426 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SLC29A1Q99808 456 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 LYRM4Q9HD34 91 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 MS4A12Q9NXJ0 267 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 KCMF1Q9P0J7 381 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ZNF639Q9UID6 485 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PHF11Q9UIL8 331 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 FBXW2Q9UKT8 454 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PSME2Q9UL46 239 aa9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CDH23Q9H251 3354 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PCM1Q15154 2024 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 A0A1B0GVT2 93 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 FAM149AA5PLN7 773 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PGRMC2O15173 223 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 TPST1O60507 370 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PRAMEF10O60809 474 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ETFAP13804 333 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 GNSP15586 552 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 ST6GAL1P15907 406 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CKMT2P17540 419 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CDH3P22223 829 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 NTSP30990 170 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CAPZBP47756 277 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 PRIM2P49643 509 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 FOLH1Q04609 750 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 BIRC2Q13490 618 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 RUNX2Q13950 521 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 MYBPC3Q14896 1274 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 DEFB133Q30KQ1 61 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 COX20Q5RI15 118 aa9.24□□□□□ -0.93
CS-209ENST00000547449 TMTC4Q5T4D3 741 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms