RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 PILRAQ9UKJ1 303 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 USP22Q9UPT9 525 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 AURKCQ9UQB9 309 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 PRAMEF10O60809 474 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ERN1O75460 977 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 GSNP06396 782 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 GSTT2P0CG29 244 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 GSTT2BP0CG30 244 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 PTPN6P29350 595 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-210ENST00000541576 ARFIP1P53367 373 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ZNF528Q3MIS6 628 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ABHD17CQ6PCB6 329 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 CAMKMTQ7Z624 323 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 MMP21Q8N119 569 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 AMER3Q8N944 861 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 VPS37AQ8NEZ2 397 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 COQ8BQ96D53 544 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 SLC6A16Q9GZN6 736 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 SEMA6CQ9H3T2 930 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 IKZF5Q9H5V7 419 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 IL21RQ9HBE5 538 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 TBC1D23Q9NUY8 699 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ATAD3AQ9NVI7 634 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ATP6V1HQ9UI12 483 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 GMEB1Q9Y692 573 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 RNF215Q9Y6U7 377 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 A0A096LPI6 279 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 A0A1B0GTQ1 180 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 A6NL46 340 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 RFXANKO14593 260 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-210ENST00000541576 FURINP09958 794 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-210ENST00000541576 GSK3BP49841 420 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 EPHA4P54764 986 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 NR1H2P55055 460 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 MTPNP58546 118 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 LIPEQ05469 1076 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 TGM3Q08188 693 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 DUOXA1Q1HG43 343 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 PRSS53Q2L4Q9 553 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 HLA-BQ31612 363 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-210ENST00000541576 TM4SF18Q96CE8 201 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ASB9Q96DX5 294 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 MTERF3Q96E29 417 aa8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-210ENST00000541576 TBCDQ9BTW9 1192 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 PIF1Q9H611 641 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 MIEF1Q9NQG6 463 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 FSCN3Q9NQT6 498 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
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THBS3-210ENST00000541576 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.25□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 A0A0A6YYD5 115 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 C4orf51C9J302 202 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 TMPRSS11DO60235 418 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 HSD17B1P14061 328 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ST6GAL1P15907 406 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ALDH4A1P30038 563 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 AVPR2P30518 371 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 RCVRNP35243 200 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 GSTM5P46439 218 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 RAB8AP61006 207 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 PDE7AQ13946 482 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 MAPK11Q15759 364 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 SPATS1Q496A3 300 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ZNF385BQ569K4 471 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 LRIF1Q5T3J3 769 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ANXA8L1Q5VT79 327 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 FRMPD2BQ6IN97 320 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 ZNF793Q6ZN11 406 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 IFNEQ86WN2 208 aa8.24□□□□□ -1.09
THBS3-210ENST00000541576 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.24□□□□□ -1.09
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