RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	RGS1	Q08116	209 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	DUSP8	Q13202	625 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	BMPR2	Q13873	1038 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	DCST1	Q5T197	706 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PLXDC2	Q6UX71	529 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	KIF18B	Q86Y91	864 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	FAM47B	Q8NA70	645 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PERP	Q96FX8	193 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SGCZ	Q96LD1	299 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	QRFPR	Q96P65	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PIP5K1A	Q99755	562 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	PARVB	Q9HBI1	364 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	EIF2B3	Q9NR50	452 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	C6orf203	Q9P0P8	240 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	WIF1	Q9Y5W5	379 aa		11.15	□□□□□ -0.62
BBS1-222	ENST00000533557	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB108A	A8MXU0	73 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CYR61	O00622	381 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	EEF1E1	O43324	174 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NRDC	O43847	1150 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	AHR	P35869	848 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HSD17B7	P56937	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CCZ1B	P86790	482 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	REEP5	Q00765	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ASPH	Q12797	758 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC13A2	Q13183	592 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PIGG	Q5H8A4	983 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CNGA4	Q8IV77	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PAQR8	Q8TEZ7	354 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DACH2	Q96NX9	599 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	OR8D2	Q9GZM6	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	GALNT8	Q9NY28	637 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PAK5	Q9P286	719 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	AMFR	Q9UKV5	643 aa		11.14	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CTAGE9	A4FU28	777 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SH3D21	A4FU49	640 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HRK	O00198	91 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	IL2RA	P01589	272 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TPM3	P06753	285 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TPM1	P09493	284 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CTSS	P25774	331 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC1A2	P43004	574 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TERF1	P54274	439 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	RAB38	P57729	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ID2	Q02363	134 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SPA17	Q15506	151 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC22A10	Q63ZE4	541 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HMBOX1	Q6NT76	420 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	OPN5	Q6U736	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PEX26	Q7Z412	305 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM132C	Q8N3T6	1108 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	MAPK1IP1L	Q8NDC0	245 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DOK4	Q8TEW6	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF721	Q8TF20	911 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SMPDL3B	Q92485	455 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC46	Q96FV0	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	NDN	Q99608	321 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CNOT11	Q9UKZ1	510 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	CLCA3P	Q9Y6N3	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	ABCA1	O95477	2261 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.12	□□□□□ -0.63
BBS1-222	ENST00000533557	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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