RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DUX5Q96PT3 197 aa6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TOR3AQ9H497 397 aa6.79□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa6.79□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLC22A2O15244 555 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SURF4O15260 269 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 STBD1O95210 358 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 AQP6Q13520 282 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADGRE1Q14246 886 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C5orf47Q569G3 176 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 CAVIN3Q969G5 261 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 TMEM80Q96HE8 168 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF570Q96NI8 536 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 MSTO1Q9BUK6 570 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 OR51M1Q9H341 326 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WDR76Q9H967 626 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.78□□□□□ -1.32
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SOX9-AS1-211ENST00000533179 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CA5BQ9Y2D0 317 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIAA0556O60303 1618 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NCOA2Q15596 1464 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEP170Q5SW79 1584 aa6.78□□□□□ -1.32
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SH3PXD2BA1X283 911 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MROH6A6NGR9 719 aa6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C9JVG2 144 aa6.77□□□□□ -1.33
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