RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526035.5

BBS1-209, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5

Gene BBS1, Length 822 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-209	ENST00000526035	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SEC16A	O15027	2179 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	FITM1	A5D6W6	292 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SERPINA6	P08185	405 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	MMP11	P24347	488 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SERPINB3	P29508	390 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	PTGER4	P35408	488 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	NEK2	P51955	445 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	EMP3	P54852	163 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	KCNK10	P57789	538 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	PHEX	P78562	749 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	PRTG	Q2VWP7	1150 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CLEC6A	Q6EIG7	209 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	BCORP1	Q8N888	145 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	RELT	Q969Z4	430 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	FAR2	Q96K12	515 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		13.91	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CHEK2	O96017	543 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	PDYN	P01213	254 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	HSD3B1	P14060	373 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	ALAS2	P22557	587 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	HSD3B2	P26439	372 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	RGS1	Q08116	209 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	GRM7	Q14831	915 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CCT7	Q99832	543 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	LHPP	Q9H008	270 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	DNAJC15	Q9Y5T4	150 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		13.9	□□□□□ -0.18
BBS1-209	ENST00000526035	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	URAD	A6NGE7	173 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	TMEM233	B4DJY2	109 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	SOCS6	O14544	535 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	P2RX6	O15547	441 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	NDUFS4	O43181	175 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	TGFB1	P01137	390 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	SERPIND1	P05546	499 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	COX6B1	P14854	86 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	HTR1E	P28566	365 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	HK2	P52789	917 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	GYS2	P54840	703 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	HYAL2	Q12891	473 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	CHSY3	Q70JA7	882 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	AGR3	Q8TD06	166 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	CCT6B	Q92526	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	THOC3	Q96J01	351 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	SERPINI1	Q99574	410 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	MS4A8	Q9BY19	250 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		13.89	□□□□□ -0.19
BBS1-209	ENST00000526035	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19

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