RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BACE1P56817 501 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSTO1P78417 241 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TNK1Q13470 666 aa0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGSF11Q5DX21 431 aa0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC25A34Q6PIV7 304 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDHR1Q96JP9 859 aa0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF586Q9NXT0 402 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF835Q9Y2P0 537 aa0.45□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 MLNRO43193 412 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MED6O75586 246 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 HSD17B1P14061 328 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DET1Q7L5Y6 550 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF149Q8NC42 400 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRTNQ99748 197 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPNE1Q99829 537 aa0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAGE1Q9NXZ1 904 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNG2Q9Y698 323 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SORL1Q92673 2214 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 LDHAP00338 332 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC10A1Q14973 349 aa0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF528Q3MIS6 628 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAB41Q5JT25 222 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUSD4Q5VX71 490 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KBTBD6Q86V97 674 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MYOCDQ8IZQ8 938 aa0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF596Q8TC21 504 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCLT1Q96NL6 688 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa0.43□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR5H15A6NDH6 313 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RNF212BA8MTL3 300 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMCO5BA8MYB1 307 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa0.42□□□□□ -2.34
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RNU6-1271P-201ENST00000517049 SCGB1D1O95968 90 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IL2RGP31785 369 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC26A2P50443 739 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS8P62241 208 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CNTN1Q12860 1018 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SNAPC1Q16533 368 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SBK1Q52WX2 424 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FUT10Q6P4F1 479 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MOB1BQ7L9L4 216 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIGWQ7Z7B1 504 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MFN1Q8IWA4 741 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR65Q8IYL9 337 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FBXW8Q8N3Y1 598 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
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