RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 NT5DC2Q9H857 520 aa18.49■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa18.49■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TXNDC16Q9P2K2 825 aa18.49■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 SPG11Q96JI7 2443 aa18.49■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 NF1P21359 2839 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 MTORP42345 2549 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 NKX2-6A6NCS4 301 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 A8MVJ9 347 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 FOXO6A8MYZ6 492 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CLDN4O14493 209 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CLEC3AO75596 197 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 PDE9AO76083 593 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TOXO94900 526 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 WDR47O94967 919 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 SAT1P21673 171 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 MSX1P28360 303 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 GP5P40197 560 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 GDF5P43026 501 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 SLC13A2Q13183 592 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 PAOXQ6QHF9 649 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CTAGE3PQ8IX95 158 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 RHBDF1Q96CC6 855 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 VPS39Q96JC1 886 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 RBBP8Q99708 897 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 UCK2Q9BZX2 261 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 DEFB127Q9H1M4 99 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 HPF1Q9NWY4 346 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 MYOTQ9UBF9 498 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 A0A088AWK7 358 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 FAM90A27PA6NNH2 459 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CYR61O00622 381 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 B3GALT2O43825 422 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 OR2J2O76002 312 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TAS2R39P59534 338 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TSNQ15631 228 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 XKR6Q5GH73 641 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 VN1R5Q7Z5H4 357 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 KRT78Q8N1N4 520 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 PPM1NQ8N819 430 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 FAM47BQ8NA70 645 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 OR2L5Q8NG80 312 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 OR2M7Q8NG81 312 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ASB15Q8WXK1 588 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CCT6BQ92526 530 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 RASL10BQ96S79 203 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CSF3RQ99062 836 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ACSS3Q9H6R3 686 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 DAPP1Q9UN19 280 aa18.47■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ACOT7O00154 380 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 OR6B1O95007 311 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ACSL3O95573 720 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 LIM2P55344 173 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 NUP107P57740 925 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 PPIAP62937 165 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 14
NELFE-212ENST00000492539 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 GRTP1Q5TC63 336 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 IL20RBQ6UXL0 311 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 RGS9BPQ6ZS82 235 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 FRA10AC1Q70Z53 315 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CLNKQ7Z7G1 428 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 SERINC2Q96SA4 455 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 TTTY12Q9BZ98 90 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 KCNJ16Q9NPI9 418 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.46■□□□□ 0.55
NELFE-212ENST00000492539 A0A0G2JMM0 328 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PPB8 328 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 A0A1W2PRS3 328 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 KIR3DP1A8MWS1 328 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 GLSO94925 669 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 CERS1P27544 350 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 SOX3P41225 446 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 PLA2G16P53816 162 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 POU4F1Q01851 419 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 PMPCAQ10713 525 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 BMPR2Q13873 1038 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 TGFBIQ15582 683 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 GXYLT1Q4G148 440 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 TRIM40Q6P9F5 258 aa18.45■□□□□ 0.54
NELFE-212ENST00000492539 ABHD17CQ6PCB6 329 aa18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms