RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RGMA	Q96B86	450 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	KCNC2	Q96PR1	638 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PPCS	Q9HAB8	311 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	KCNK13	Q9HB14	408 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	DCDC2	Q9UHG0	476 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PCSK5	Q92824	1860 aa		10.83	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TLDC2	A0PJX2	215 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283		A8MUA0	341 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	EPOR	P19235	508 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	GCA	P28676	217 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PIK3CB	P42338	1070 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SLCO1A2	P46721	670 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	CCT5	P48643	541 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RAB38	P57729	211 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RHAG	Q02094	409 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PCDH1	Q08174	1060 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MFAP5	Q13361	173 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RUNX2	Q13950	521 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TSLP	Q969D9	159 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MS4A8	Q9BY19	250 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TXLNGY	Q9BZA5	131 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	OR51B5	Q9H339	312 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	LANCL2	Q9NS86	450 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ABI3	Q9P2A4	366 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		10.82	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283		A0A1W2PQ72	361 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ESPN	B1AK53	854 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283		H0YIV9	168 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SAP18	O00422	153 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	E2F3	O00716	465 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SUPT7L	O94864	414 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	IFNA16	P05015	189 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	GSTA1	P08263	222 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ITGAM	P11215	1152 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TNNI3	P19429	210 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MAOA	P21397	527 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	CERS1	P27544	350 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TLX1	P31314	330 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SSR2	P43308	183 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	HSD17B7	P56937	341 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF33B	Q06732	778 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	STX4	Q12846	297 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	IFT88	Q13099	833 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	TLR1	Q15399	786 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SHISA5	Q8N114	240 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	M1AP	Q8TC57	530 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	AICDA	Q9GZX7	198 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	DAPP1	Q9UN19	280 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	COPG1	Q9Y678	874 aa	Known RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	C4orf51	C9J302	202 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	OTC	P00480	354 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	CELA2A	P08217	269 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	CPN2	P22792	545 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	NEK2	P51955	445 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	CDH13	P55290	713 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	LIM2	P55344	173 aa		10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
RBMS1-215	ENST00000492283	SLAMF1	Q13291	335 aa		10.8	□□□□□ -0.68

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