RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LRRC57Q8N9N7 239 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 IRF7Q92985 503 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SUSD3Q96L08 255 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CD244Q9BZW8 370 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KCNH6Q9H252 994 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR51I1Q9H343 314 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NANSQ9NR45 359 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PPL8 197 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PBX1P40424 430 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF460Q14592 562 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMEM35AQ53FP2 167 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ACSBG2Q5FVE4 666 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CARM1Q86X55 608 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR8J3Q8NGG0 315 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ASB12Q8WXK4 309 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ARMC5Q96C12 935 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GPR22Q99680 433 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MTG2Q9H4K7 406 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 UBR1Q8IWV7 1749 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FAAHO00519 579 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FOSL1P15407 271 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GPM6BQ13491 265 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RAB30Q15771 203 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C2orf27AQ580R0 203 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ATG9BQ674R7 924 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.44□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MEGF11A6BM72 1044 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR6C6A6NF89 314 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 A8MUA0 341 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PFKMP08237 780 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GDI1P31150 447 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PTGIRP43119 386 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GSK3BP49841 420 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CASP7P55210 303 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CCINQ13939 588 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NADK2Q4G0N4 442 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 BEST3Q8N1M1 668 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC22A8Q8TCC7 542 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SAMD11Q96NU1 681 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HDHD5Q9BXW7 423 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 C2orf72A6NCS6 295 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MMP20O60882 483 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 B4GALT2O60909 372 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ELOCQ15369 112 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 MYLK3Q32MK0 819 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TMEM205Q6UW68 189 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ARNTL2Q8WYA1 636 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SMOC2Q9H3U7 446 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TAC3Q9UHF0 121 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ERVK-19Q9WJR5 959 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 NFAT5O94916 1531 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SLC16A5O15375 505 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 LATO43561 262 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 HLA-DQB2P05538 268 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR4Q2P0C623 313 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CHRNB4P30926 498 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CREB5Q02930 508 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR4F3Q6IEY1 312 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 CASTOR1Q8WTX7 329 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 PYCR2Q96C36 320 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 SCRN2Q96FV2 425 aa6.43□□□□□ -1.38
USP46-201ENST00000441222 TTYH3Q9C0H2 523 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms