RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PFDN6O15212 129 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 OR1F1O43749 312 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PEX1O43933 1283 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PDE9AO76083 593 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 FGGP02679 453 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TPOP07202 933 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM10L1P0DMW3 83 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ALOX12P18054 663 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 IL10P22301 178 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PPP2R1BP30154 601 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PTGS2P35354 604 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEA3P43357 314 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CYB561P49447 251 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CDKN2DP55273 166 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R50P59544 299 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 GPR85P60893 370 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 GPS1Q13098 491 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CASC4Q6P4E1 433 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 HORMAD2Q8N7B1 307 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ABHD11Q8NFV4 315 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 NT5CQ8TCD5 201 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SMIM10Q96HG1 83 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SARGQ9BW04 601 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL31Q9H511 634 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CLDN16Q9Y5I7 305 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0G2JMM0 328 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PPB8 328 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PRS3 328 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TRBC2A0A5B9 178 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM200CA6NKL6 621 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TFECO14948 347 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 NDUFS4O43181 175 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CEP104O60308 925 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SERPIND1P05546 499 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PAMP19021 973 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 MAPK1P28482 360 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CXCR5P32302 372 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 HNF4AP41235 474 aa6.09□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 ART1P52961 327 aa6.09□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 NUP107P57740 925 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LINC00310P59036 64 aa6.09□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 HERC3Q15034 1050 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 QSOX2Q6ZRP7 698 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CA13Q8N1Q1 262 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 OR56A3Q8NH54 315 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SNF8Q96H20 258 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SERPINB12Q96P63 405 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC68Q9H2F9 335 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 RHBGQ9H310 441 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LIME1Q9H400 295 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PARVBQ9HBI1 364 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 COQ3Q9NZJ6 369 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SDR42E2A6NKP2 422 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 FANCGO15287 622 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 BANF1O75531 89 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 ITGA10O75578 1167 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 SLU7O95391 586 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HOXD8-202ENST00000429017 KRT14P02533 472 aa6.08□□□□□ -1.44
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