RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 USP51Q70EK9 711 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SYT13Q7L8C5 426 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D19Q8N5T2 526 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 DEFB119Q8N690 84 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KCT2Q8NC54 265 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR2L5Q8NG80 312 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 MSANTD3Q96H12 275 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR6C74A6NCV1 312 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 B4GALT2O60909 372 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TNFP01375 233 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 THEGLP0DJG4 465 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PIGAP37287 484 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PXNP49023 591 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9A5Q14940 896 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 NADK2Q4G0N4 442 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PAQR7Q86WK9 346 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TAMM41Q96BW9 452 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 MBOAT4Q96T53 435 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TBX19O60806 448 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 IGLV3-19P01714 112 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 C1orf61Q13536 156 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SZRD1Q7Z422 152 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 DOHHQ9BU89 302 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TM9SF3Q9HD45 589 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 H0YAE9 185 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 M0QX08 132 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 MAN2B1O00754 1011 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 PGRMC2O15173 223 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CCR5P51681 352 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 MYBPC3Q14896 1274 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 HORMAD2Q8N7B1 307 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 C7orf34Q96L11 122 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 OR2A14Q96R47 310 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SARGQ9BW04 601 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM38AQ9H6F2 299 aa22.01■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 A0A1W2PR48 441 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 VIPP01282 170 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ALPPL2P10696 532 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 UGT2B7P16662 529 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CD6P30203 668 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 OR1E2P47887 323 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 DSTNP60981 165 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SELENOWP63302 87 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF750Q32MQ0 723 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 HIPK1Q86Z02 1210 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ARL10Q8N8L6 244 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 NEUROD4Q9HD90 331 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 USE1Q9NZ43 259 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 ASB4Q9Y574 426 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SH3BP5O60239 455 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF10O60809 474 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 MITFO75030 526 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CLCN2P51788 898 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RBBP4Q09028 425 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 KCNAB2Q13303 367 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TP53BP2Q13625 1128 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 FZD2Q14332 565 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 UBXN2BQ14CS0 331 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SAXO2Q658L1 398 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 C18orf63Q68DL7 685 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT5Q7Z7M9 940 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SMYD1Q8NB12 490 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 GPBAR1Q8TDU6 330 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RAB8BQ92930 207 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 NEURL3Q96EH8 262 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 FAM118AQ9NWS6 357 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CPNE7Q9UBL6 633 aa22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC88CQ9P219 2028 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms