RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
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POLR1A-204ENST00000424089 ORC6Q9Y5N6 252 aa9.55□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 APC2O95996 2303 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 PRSS38A1L453 326 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 H7BY64 318 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 PLPP1O14494 284 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 SUV39H1O43463 412 aa9.54□□□□□ -0.88
POLR1A-204ENST00000424089 OR1F1O43749 312 aa9.54□□□□□ -0.88
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