RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 SP140LQ9H930 580 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CLN6Q9NWW5 311 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 KCND3Q9UK17 655 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 KLK4Q9Y5K2 254 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 RECKO95980 971 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 TIMP1P01033 207 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ADH5P11766 374 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 C6P13671 934 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 DPTQ07507 201 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CDC20Q12834 499 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 KLHL17Q6TDP4 642 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 FAM129CQ86XR2 697 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 MMP21Q8N119 569 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 NATD1Q8N6N6 113 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 NEURL3Q96EH8 262 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 OR51E2Q9H255 320 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 IFT52Q9Y366 437 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 C5orf58C9J3I9 102 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 M0R129 80 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 DSCR3O14972 297 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 VEGFDO43915 354 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 GASTP01350 101 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CYP17A1P05093 508 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 KELP23276 732 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CEACAM20Q6UY09 585 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 TMIEQ8NEW7 156 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 OR5P2Q8WZ92 322 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 IL17FQ96PD4 163 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 A4GALTQ9NPC4 353 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ASF1AQ9Y294 204 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 DDCP20711 480 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CHMP24386 653 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 LIMK1P53667 647 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 DUSP7Q16829 419 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 SAXO2Q658L1 398 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 FRMPD2BQ6IN97 320 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 PTCHD4Q6ZW05 846 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 LYSMD2Q8IV50 215 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CDADC1Q9BWV3 514 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ABCB10Q9NRK6 738 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 AQP9O43315 295 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 TBX19O60806 448 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 SEMA3DO95025 777 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 S100A5P33763 92 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF45Q02386 682 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 TPRG1LQ5T0D9 272 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 OR52A5Q9H2C5 316 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 CPNE5Q9HCH3 593 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 PRDM8Q9NQV8 689 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 POLE4Q9NR33 117 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 RHCGQ9UBD6 479 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF229Q9UJW7 825 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXD13-201ENST00000392539 MMP20O60882 483 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 CYP4F2P78329 520 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 FAM92BQ6ZTR7 304 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 OR8D1Q8WZ84 308 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 RHBGQ9H310 441 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 SLC6A14Q9UN76 642 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 ANKDD1BA6NHY2 528 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 PLPP1O14494 284 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 KDM1AO60341 852 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 HSMCR30P0CW71 290 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 DDX5P17844 614 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 FUT4P22083 530 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 SERPINB1P30740 379 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 PRKCDQ05655 676 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 PNCKQ6P2M8 343 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 DSG4Q86SJ6 1040 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 PDZD3Q86UT5 571 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 C12orf40Q86WS4 652 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 FAM46DQ8NEK8 389 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 TMCC3Q9ULS5 477 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 PLAGL1Q9UM63 463 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 NINQ8N4C6 2090 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 ZW10O43264 779 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 CNR2P34972 360 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 MAPK12P53778 367 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXD13-201ENST00000392539 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms