RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384114.1

RNU6-409P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 409, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-409P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-409P-201ENST00000384114 BACE1P56817 501 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RPS8P62241 208 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ZNF630Q2M218 657 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ANKRD55Q3KP44 614 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TMEM211Q6ICI0 200 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MACC1Q6ZN28 852 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CHST9Q7L1S5 443 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CLEC1AQ8NC01 280 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MDS2Q8NDY4 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CD99L2Q8TCZ2 262 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MYDGFQ969H8 173 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MARC2Q969Z3 335 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MOB3AQ96BX8 217 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC25A38Q96DW6 304 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CCDC34Q96HJ3 373 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CDHR1Q96JP9 859 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SEPHS2Q99611 448 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 OSBPL11Q9BXB4 747 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ULBP2Q9BZM5 246 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SH3GLB2Q9NR46 395 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CLIC5Q9NZA1 410 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC13A4Q9UKG4 626 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TBX21Q9UL17 535 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PDE10AQ9Y233 779 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PPIAL4AQ9Y536 164 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 B4DLN1 442 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 H3BMM5 538 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 NBR2O15453 112 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MLNRO43193 412 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MBD4O95243 580 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FGF19O95750 216 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CLTBP09497 229 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GOT1P17174 413 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 DNASE1P24855 282 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CTNNA2P26232 953 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CTRLP40313 264 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 OR3A4PP47883 348 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CCR9P51686 369 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MFAP4P55083 255 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CDH13P55290 713 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 UBASH3AP57075 661 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CACNG1Q06432 222 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MADCAM1Q13477 382 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 CRYMQ14894 314 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC10A1Q14973 349 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TAF9Q16594 264 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SNX30Q5VWJ9 437 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 MOB1BQ7L9L4 216 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 LAX1Q8IWV1 398 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FBXW8Q8N3Y1 598 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PDILTQ8N807 584 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 BBS1Q8NFJ9 593 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ATL1Q8WXF7 558 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SEPT1Q8WYJ6 367 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PROX1Q92786 737 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TNMDQ9H2S6 317 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 OR51J1Q9H342 316 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RNF121Q9H920 327 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 TIGARQ9NQ88 270 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 WASH6PQ9NQA3 447 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 DPM3Q9P2X0 92 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 RNF150Q9ULK6 438 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SHROOM3Q8TF72 1996 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 A0A096LNJ9 63 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 A0A1W2PPM1 405 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PIP5K1CO60331 668 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 GSRP00390 522 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 FCGR3AP08637 254 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SP9P0CG40 484 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 HSD17B1P14061 328 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 PDGFRAP16234 1089 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 XBP1P17861 261 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 ADRA2CP18825 462 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 KIR3DL2P43630 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
RNU6-409P-201ENST00000384114 SLC26A2P50443 739 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms