RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368547.3

ECHS1-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase, short chain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHS1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1-201ENST00000368547 CA13Q8N1Q1 262 aa27.93■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP27.93■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 DAPP1Q9UN19 280 aa27.93■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 STMND1H3BQB6 276 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 FAM58BPP0C7Q3 252 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CD82P27701 267 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 DIO3P55073 304 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 LIM2P55344 173 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 RPS6KA2Q15349 733 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 COX15Q7KZN9 410 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 YIPF2Q9BWQ6 316 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZIM2Q9NZV7 527 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 TRPC4Q9UBN4 977 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 FBXW2Q9UKT8 454 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ONECUT2O95948 504 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CCNYL3P0C7X3 344 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 IL23RQ5VWK5 629 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 SNX32Q86XE0 403 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 POU5F2Q8N7G0 328 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 OR51Q1Q8NH59 317 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CHST8Q9H2A9 424 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 LYRM4Q9HD34 91 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R1Q9NYW7 299 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 KCMF1Q9P0J7 381 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 PADI1Q9ULC6 663 aa27.92■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 B2RBV5 119 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 MAPK1P28482 360 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 AGKQ53H12 422 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 TSPEARQ8WU66 669 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 PEX11GQ96HA9 241 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ACSL6Q9UKU0 697 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ASB4Q9Y574 426 aa27.91■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 SCN2AQ99250 2005 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 LOC100653049A0A140TA62 436 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 KRT34O76011 436 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 BCKDHAP12694 445 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 SDC1P18827 310 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF763Q0D2J5 394 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 MAP7Q14244 749 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 RINLQ6ZS11 566 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 GPR180Q86V85 440 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 FAM9CQ8IZT9 166 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 NLGN4XQ8N0W4 816 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ESX1Q8N693 406 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 EFCAB3Q8N7B9 438 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 SLC25A23Q9BV35 468 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ATG4BQ9Y4P1 393 aa27.9■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 GYG2O15488 501 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 RNH1P13489 461 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 TACR1P25103 407 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 XCR1P46094 333 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CPA2P48052 419 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 SHC2P98077 582 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 STX5Q13190 355 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 LIX1Q8N485 282 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 C16orf78Q8WTQ4 265 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CCDC167Q9P0B6 97 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 CTSFQ9UBX1 484 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 PHF11Q9UIL8 331 aa27.89■■■□□ 2.06
ECHS1-201ENST00000368547 RAD1O60671 282 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 RAB38P57729 211 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 TAS2R50P59544 299 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 DNAL1Q4LDG9 190 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 MLIPQ5VWP3 458 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 PAOXQ6QHF9 649 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 OVCH1Q7RTY7 1134 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 FUNDC1Q8IVP5 155 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 CDC26Q8NHZ8 85 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 TM4SF18Q96CE8 201 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 RBCK1Q9BYM8 510 aa27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 CPN2P22792 545 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 TBC1D25Q3MII6 688 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM198BQ6UWH4 519 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 FAM47BQ8NA70 645 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 EGLN2Q96KS0 407 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 TSSK3Q96PN8 268 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 CSF3RQ99062 836 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 MS4A12Q9NXJ0 267 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 SPACA6W5XKT8 324 aa27.88■■■□□ 2.05
ECHS1-201ENST00000368547 A0A1W2PR48 441 aa27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms