RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362830.1

RNU6-223P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 223, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-223P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-223P-201ENST00000362830 EDNRAP25101 427 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 FEN1P39748 380 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 OPRL1P41146 370 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TNFRSF4P43489 277 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 RGS19P49795 217 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCL11P51671 97 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TKTL1P51854 596 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 SPP2Q13103 211 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 KRT31Q15323 416 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF528Q3MIS6 628 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TCEAL6Q6IPX3 200 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 GALNT17Q6IS24 598 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TMEM26Q6ZUK4 368 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 HOGA1Q86XE5 327 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 BATF2Q8N1L9 274 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 RNF149Q8NC42 400 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR10G8Q8NGN5 311 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 C11orf45Q8TAV5 145 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 GLYATL1Q969I3 302 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 COQ7Q99807 217 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 LRRC2Q9BYS8 371 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCSER1Q9C0I3 900 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ABCG4Q9H172 646 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 IL20RAQ9UHF4 553 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCPG1Q9ULG6 757 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PLCL2Q9UPR0 1127 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 MMP24Q9Y5R2 645 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 A0A087WW49 117 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 OGTO15294 1046 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 LANCL1O43813 399 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 GAS8O95995 478 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF883P0CG24 379 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CYP11B1P15538 503 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CEBPBP17676 345 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 FCARP24071 287 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHRNB4P30926 498 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CHRNA3P32297 505 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 HSPA1LP34931 641 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC1A3P43003 542 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCR4P51679 360 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 LIMK2P53671 638 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ITPK1Q13572 414 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 HEPACAMQ14CZ8 416 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TAB1Q15750 504 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CMPK2Q5EBM0 449 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 UNC5DQ6UXZ4 953 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 MACC1Q6ZN28 852 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 Q6ZSR9 355 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 Q6ZVQ6 151 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 BNIPLQ7Z465 357 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TAF8Q7Z7C8 310 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ITIH5Q86UX2 942 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 KDM8Q8N371 416 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 MINDY2Q8NBR6 621 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP8B4Q8TF62 1192 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 SUSD6Q92537 303 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 TAF4BQ92750 862 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 RAB39BQ96DA2 213 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 OMA1Q96E52 524 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCED1BQ96HM7 432 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PCDHB18PQ96TA0 734 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 UBAC1Q9BSL1 405 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 FUCA2Q9BTY2 467 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 NGBQ9NPG2 151 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 EXOC1Q9NV70 894 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 HPF1Q9NWY4 346 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CLIP2Q9UDT6 1046 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 BLOC1S6Q9UL45 172 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ERVK-19Q9WJR5 959 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 WDR37Q9Y2I8 494 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 C15orf61A6NNL5 157 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 HSF2BPO75031 334 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ATP6V1G1O75348 118 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 ANGPTL1O95841 491 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 IFNB1P01574 187 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 HMBSP08397 361 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-223P-201ENST00000362830 CCDC192P0DO97 292 aa2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms