RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360047.9

PDE4D-205, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-205ENST00000360047 GABRG2P18507 467 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 C5AR1P21730 350 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 MATN1P21941 496 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 FNTBP49356 437 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 RPS14P62263 151 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 CHAF1BQ13112 559 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 GARNL3Q5VVW2 1013 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 ZNF773Q6PK81 442 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 CLEC4FQ8N1N0 589 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 GPR150Q8NGU9 434 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 RNF170Q96K19 258 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 MRGPRX1Q96LB2 322 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 TEKT5Q96M29 485 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 IL12RB2Q99665 862 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 SAYSD1Q9NPB0 183 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 C11orf16Q9NQ32 467 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 C2orf42Q9NWW7 574 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 GLTPQ9NZD2 209 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 EYSQ5T1H1 3165 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 A0A1W2PP55 124 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 LINC00862A6NCI5 91 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 AGAP14A8MT82 685 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 OXTRP30559 389 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 BST1Q10588 318 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 TEX26Q8N6G2 289 aa4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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PDE4D-205ENST00000360047 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 PAK5Q9P286 719 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 CD300AQ9UGN4 299 aa4.75□□□□□ -1.65
PDE4D-205ENST00000360047 FBXO4Q9UKT5 387 aa4.75□□□□□ -1.65
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