RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SOAT1P35610 550 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 NNMTP40261 264 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CYP4F2P78329 520 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 GANABQ14697 944 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SSX1Q16384 188 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TSTQ16762 297 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 HEATR4Q86WZ0 1026 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 NEURL3Q96EH8 262 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DHRS1Q96LJ7 313 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 MARK1Q9P0L2 795 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA7Q9P0W8 599 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 FFAR1O14842 300 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 HSMCR30P0CW71 290 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SPNP16150 400 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 STARD3Q14849 445 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SPANXN2Q5MJ10 180 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 MEDAGQ5VYS4 303 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 VN1R5Q7Z5H4 357 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 KREMEN2Q8NCW0 462 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CAPNS2Q96L46 248 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CTRCQ99895 268 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 CXorf36Q9H7Y0 433 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DEFA1P59665 94 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DEFA3P59666 94 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 MED22Q15528 200 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DUSP7Q16829 419 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM53Q6P2H8 277 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP206Q8IYR0 622 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TAGAPQ8N103 731 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 NATD1Q8N6N6 113 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 VN1R2Q8NFZ6 395 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SORCS1Q8WY21 1168 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 OPALINQ96PE5 141 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 C3orf14Q9HBI5 128 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 REV1Q9UBZ9 1251 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SCG5P05408 212 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 OSMP13725 252 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 LRIT3Q3SXY7 679 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 SLX4IPQ5VYV7 408 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DESI1Q6ICB0 168 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 DOC2BQ14184 412 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 IER5LQ5T953 404 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 ZNF765Q7L2R6 523 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 ERLEC1Q96DZ1 483 aa21.48■■□□□ 1.03
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HOXD1-201ENST00000331462 DPEP2Q9H4A9 486 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TDP1Q9NUW8 608 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 MGAT4BQ9UQ53 548 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 CCL16O15467 120 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 PI15O43692 258 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 DYRK3O43781 588 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 MOSPD3O75425 235 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 GPX5O75715 221 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ACADLP28330 430 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF77Q15935 545 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 C12orf73Q69YU5 71 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 LCTLQ6UWM7 567 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXD1-201ENST00000331462 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa21.47■■□□□ 1.03
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