RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 AIFM1O95831 613 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 JMJD7P0C870 316 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 T-ENOLP0DO92 83 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 GCGRP47871 477 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RASSF2P50749 326 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RHBDD2Q6NTF9 364 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS37AQ8NEZ2 397 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DUSP26Q9BV47 211 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RMND5AQ9H871 391 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 EHD3Q9NZN3 535 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PSME2Q9UL46 239 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC187A0A096LP49 1063 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 AIM2O14862 343 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DKK1O94907 266 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 UNC5CO95185 931 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNH1P13489 461 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB38P57729 211 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB15P59190 212 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ART3Q13508 389 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PDE7AQ13946 482 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANXA8L1Q5VT79 327 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 C18orf63Q68DL7 685 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CEACAM20Q6UY09 585 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CAMKMTQ7Z624 323 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MMP21Q8N119 569 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DTWD1Q8N5C7 304 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8J2Q8NGG1 315 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL26A1Q96A83 441 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RCN3Q96D15 328 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 COQ8BQ96D53 544 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTKNQ9BST9 563 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 YIPF2Q9BWQ6 316 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAU2Q9Y6X3 613 aa25.92■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRASO14807 208 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DNAJB6O75190 326 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 LAMP1P11279 417 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHC2P98077 582 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPKAPK3Q16644 382 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf189Q5VU69 101 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 REP15Q6BDI9 236 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR4F3Q6IEY1 312 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NATD1Q8N6N6 113 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM47BQ8NA70 645 aa25.91■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF304Q9HCX3 659 aa25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCNX2A6NKB5 2137 aa25.9■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 B2RBV5 119 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 TBX19O60806 448 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATXN8OSP0DMR3 200 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBLP22087 321 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR1D4P47884 311 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 COQ5Q5HYK3 327 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCAF12Q5T6F0 453 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPAS2Q99743 824 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 GIMAP4Q9NUV9 329 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTS2RQ9UKP6 389 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCN3AQ9NY46 2000 aa25.9■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 TIAF1O95411 115 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NTRK1P04629 796 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NUDT2P50583 147 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK10P53779 464 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ARHGAP40Q5TG30 622 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52E8Q6IFG1 317 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR51Q1Q8NH59 317 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC52A3Q9NQ40 469 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM9Q9NQV7 894 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PISDQ9UG56 409 aa25.89■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 FBP2O00757 339 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLD2O14939 933 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 PGRMC2O15173 223 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITIH1P19827 911 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 LRRC74AQ0VAA2 488 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSG2Q14126 1118 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC48A1Q6P1K1 146 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLHL29Q96CT2 875 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 PEX11GQ96HA9 241 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITCHQ96J02 903 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSF3RQ99062 836 aa25.88■■□□□ 1.73
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZPBPQ9BS86 351 aa25.88■■□□□ 1.73
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