RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301764.11

DDB1-201, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DDB1, Length 4,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1-201ENST00000301764 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 MEN1O00255 615 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 E2F3O00716 465 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 ALPPP05187 535 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 PRKACAP17612 351 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 EVI2BP34910 448 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 CCL23P55773 120 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 SLC35A2P78381 396 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 UPP1Q16831 310 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 ZNF438Q7Z4V0 828 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 FTMTQ8N4E7 242 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 NDC1Q9BTX1 674 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 ACPTQ9BZG2 426 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 TMEM27Q9HBJ8 222 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 NUDT15Q9NV35 164 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 H7C2Y5 167 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 TACR1P25103 407 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 KHKP50053 298 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 SELENOWP63302 87 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 SGCGQ13326 291 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 AGMOQ6ZNB7 445 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 KLBQ86Z14 1044 aa14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
DDB1-201ENST00000301764 GRM6O15303 877 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 PROM1O43490 865 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 CYP17A1P05093 508 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 MAPK9P45984 424 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 FADDQ13158 208 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 RGNQ15493 299 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TPRG1Q6ZUI0 275 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TCF7L1Q9HCS4 588 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 A0A0U1RQF3 1178 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ARHGAP33O14559 1287 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 STATHP02808 62 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 F8A1P23610 371 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ZNF366Q8N895 744 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 OR2AP1Q8NGE2 309 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 A0A1B0GVC2 190 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 A6NIN4 97 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 GNB5O14775 395 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SLC19A2O60779 497 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 GPR32O75388 356 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ECDO95905 644 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ALPPL2P10696 532 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ARF5P84085 180 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ZNF234Q14588 700 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SLC9A5Q14940 896 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SCD5Q86SK9 330 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 FBXO22Q8NEZ5 403 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SCAMP4Q969E2 229 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SLC35B4Q969S0 331 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 OR2AG1Q9H205 316 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 FBXO8Q9NRD0 319 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 BCORQ6W2J9 1755 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 FAAHO00519 579 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 PCDHGA12O60330 932 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 PRAMEF12O95522 483 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 NUDT7P0C024 238 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 JUPP14923 745 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 LINC00299Q6ZSB3 139 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 GALNT11Q8NCW6 608 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 CLIP3Q96DZ5 547 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 OR5M11Q96RB7 305 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 CLMPQ9H6B4 373 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.64□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 OR10H2O60403 315 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ASGR1P07306 291 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 MTHFD2P13995 350 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 HMGCLP35914 325 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 NKX3-2P78367 333 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 SERPINA11Q86U17 422 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 ARRDC2Q8TBH0 407 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.63□□□□□ -0.07
DDB1-201ENST00000301764 LRP5O75197 1615 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms