RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293362.7

PSME3-201, Transcript of proteasome activator subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PSME3, Length 3,144 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME3-201ENST00000293362 TRIM48Q8IWZ4 208 aa9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 EID3Q8N140 333 aa9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 OR2L8Q8NGY9 312 aa9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 CREB3L4Q8TEY5 395 aa9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 RGMAQ96B86 450 aa9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 SPAG17Q6Q759 2223 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 SUV39H1O43463 412 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 FABP3P05413 133 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 BCHEP06276 602 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 DDCP20711 480 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 AGXTP21549 392 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 DUSP2Q05923 314 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 ZNF33BQ06732 778 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 EOGTQ5NDL2 527 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 HORMAD2Q8N7B1 307 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 C11orf65Q8NCR3 313 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 TSC22D3Q99576 134 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 PELI2Q9HAT8 420 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 MMP17Q9ULZ9 603 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 DENND4AQ7Z401 1863 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 PTGES3LE9PB15 166 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 PDPK1O15530 556 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 MBTPS2O43462 519 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 IGHV4-34P06331 123 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 BTN3A2P78410 334 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 HYAL2Q12891 473 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 PDE7AQ13946 482 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 NEDD8Q15843 81 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 OR2T5Q6IEZ7 315 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 TAF8Q7Z7C8 310 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 NRROSQ86YC3 692 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 OR2T29Q8NH02 315 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 DNAJB8Q8NHS0 232 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 XAGE5Q8WWM1 108 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 TAMM41Q96BW9 452 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 LMAN1LQ9HAT1 526 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 CTPS2Q9NRF8 586 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 SIRT5Q9NXA8 310 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 TRPC4Q9UBN4 977 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa9.65□□□□□ -0.86
PSME3-201ENST00000293362 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 A0A1W2PR48 441 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 TMEM229AB2RXF0 380 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 FAM227AF5H4B4 570 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 MAN1A2O60476 641 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 CTSBP07858 339 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 NAT1P18440 290 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 RRM2P31350 389 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 CDK6Q00534 326 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 MAP7Q14244 749 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 HEPACAMQ14CZ8 416 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 GPR19Q15760 415 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 DUSP7Q16829 419 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 DEFB110Q30KQ9 67 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 DEFB134Q4QY38 66 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 OR4N4Q8N0Y3 316 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 ATG16L2Q8NAA4 619 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 STARD8Q92502 1023 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 NLNQ9BYT8 704 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 CHST8Q9H2A9 424 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 SPATA7Q9P0W8 599 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa9.65□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 PRSS47A8MTI9 375 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 GPR89AB7ZAQ6 455 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 ZW10O43264 779 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 TPST2O60704 377 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 CTSVO60911 334 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 GPR89BP0CG08 455 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 IL1RNP18510 177 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 MYF6P23409 242 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 GSTT1P30711 240 aa9.64□□□□□ -0.87
PSME3-201ENST00000293362 HSD17B2P37059 387 aa9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms