RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 EVPLLA8MZ36 301 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 M0R296 226 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CASC3O15234 703 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PROM1O43490 865 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 AIFM1O95831 613 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C9P02748 559 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NTRK1P04629 796 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CAPNS1P04632 268 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT7P0C024 238 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MYF5P13349 255 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DRD2P14416 443 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GFERP55789 205 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RGNQ15493 299 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 COX20Q5RI15 118 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35F3Q8IY50 421 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NETO1Q8TDF5 533 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NSMCE2Q96MF7 247 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf36Q9H7Y0 433 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FBXW2Q9UKT8 454 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CES1P1Q9UKY3 287 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SCN2AQ99250 2005 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 A0A1W2PS29 197 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CXCR6O00574 342 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TIPRLO75663 272 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CASP9P55211 416 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TAF11Q15544 211 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIP10Q15642 601 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB110Q30KQ9 67 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFB134Q4QY38 66 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NKAIN2Q5VXU1 208 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 IRGCQ6NXR0 463 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 FAM92BQ6ZTR7 304 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZZZ3Q8IYH5 903 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CAMKVQ8NCB2 501 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5AK3PQ8NH89 298 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35A5Q9BS91 424 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 STARD5Q9NSY2 213 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 EHD3Q9NZN3 535 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 KCMF1Q9P0J7 381 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 LRIT1Q9P2V4 623 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 AURKCQ9UQB9 309 aa8.85□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PDPK1O15530 556 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALT2O60909 372 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GNSP15586 552 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 IL1RNP18510 177 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CDH3P22223 829 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 KLHL35Q6PF15 583 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PDSS2Q86YH6 399 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 EPS8L2Q9H6S3 715 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 UTS2RQ9UKP6 389 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PCDHGB4Q9UN71 923 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CREG1O75629 220 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 GPIP06744 558 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CFHR1Q03591 330 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DUSP2Q05923 314 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 RUNX2Q13950 521 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NKG7Q16617 165 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF750Q32MQ0 723 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CPZQ66K79 652 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ARL10Q8N8L6 244 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 OR52E4Q8NGH9 312 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 C1GALT1Q9NS00 363 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 V9GYQ6 96 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDH4A1P30038 563 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 OR1D5P58170 312 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 VMACQ2NL98 169 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TBCELQ5QJ74 424 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SLC48A1Q6P1K1 146 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 DNAJC22Q8N4W6 341 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 CSNK1A1LQ8N752 337 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 TNIP2Q8NFZ5 429 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 SUN3Q8TAQ9 357 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 OR5P2Q8WZ92 322 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 PIGKQ92643 395 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGEF1-201ENST00000284957 MAL2Q969L2 176 aa8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms