RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 DOHHQ9BU89 302 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TAS2R7Q9NYW3 318 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 USE1Q9NZ43 259 aa22.74■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OR5K4A6NMS3 321 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 H3BNH8 94 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CLIC3O95833 236 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 UGT2B7P16662 529 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FRKP42685 505 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 RAB8AP61006 207 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 LIN52Q52LA3 116 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM26Q6ZUK4 368 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TRIM73Q86UV7 250 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PATE1Q8WXA2 126 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 NEURL3Q96EH8 262 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2A14Q96R47 310 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ANGPT4Q9Y264 503 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ORC6Q9Y5N6 252 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 C4orf51C9J302 202 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 MAGP20916 626 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 BLKP51451 505 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 VLDLRP98155 873 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PPP2R2BQ00005 443 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FZD2Q14332 565 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OFCC1Q8IZS5 231 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF786Q8N393 782 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 LZICQ8WZA0 190 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TBC1D20Q96BZ9 403 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 EPS8L2Q9H6S3 715 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ACTR10Q9NZ32 417 aa22.73■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A0G2JNG1 304 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 A0A1W2PPC1 479 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 KIR2DS3K7RE56 304 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 HS6ST1O60243 411 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 IFNA14P01570 189 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35G6P0C7Q6 338 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 NTSP30990 170 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GPC1P35052 558 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SELENOWP63302 87 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 KIR2DS5Q14953 304 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SAXO2Q658L1 398 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CEACAM20Q6UY09 585 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ASPGQ86U10 573 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF687Q8N1G0 1237 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 BBS4Q96RK4 519 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ARAFP10398 606 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CERS1P27544 350 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 RXRGP48443 463 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CRYBA2P53672 197 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GAS6Q14393 721 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 MLC1Q15049 377 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ZFP28Q8NHY6 868 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 UCN3Q969E3 161 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 TOR3AQ9H497 397 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ASB4Q9Y574 426 aa22.72■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OR2A25A4D2G3 310 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GLOD5A6NK44 160 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 DIRAS1O95057 198 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 OPN1SWP03999 348 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PARGQ86W56 976 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL10Q8N8L6 244 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF555Q8NEP9 628 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SPPL2AQ8TCT8 520 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 GAL3ST3Q96A11 431 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC6A18Q96N87 628 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 SYNPO2LQ9H987 977 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 C3orf18Q9UK00 162 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ATG4BQ9Y4P1 393 aa22.71■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 C2orf74A8MZ97 194 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFS2O75306 463 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 PRKACGP22612 351 aa22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
RPUSD1-201ENST00000007264 CCT3P49368 545 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms