RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CERS6Q6ZMG9 384 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35D2Q76EJ3 337 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 P4HA3Q7Z4N8 544 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SFR1Q86XK3 245 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HPS6Q86YV9 775 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRG5Q8IZF4 528 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP24Q8N264 748 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 STK40Q8N2I9 435 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf78Q8N4C9 275 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC44A3Q8N4M1 653 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM89BQ8N5H3 189 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB2Q8N680 514 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 TC2NQ8N9U0 490 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 L3MBTL4Q8NA19 623 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM47BQ8NA70 645 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 UXS1Q8NBZ7 420 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 CCDC197Q8NCU1 140 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC17A8Q8NDX2 589 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 OR10H4Q8NGA5 316 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR4K14Q8NGD5 310 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR13C9Q8NGT0 318 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM172AQ8WUF8 416 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35F5Q8WV83 523 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG8Q8WXS5 425 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C22orf15Q8WYQ4 148 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HSD17B8Q92506 261 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TOP1MTQ969P6 601 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RAB24Q969Q5 203 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ECHDC3Q96DC8 303 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SGTBQ96EQ0 304 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RNF145Q96MT1 663 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RILPQ96NA2 401 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 SYT15Q9BQS2 421 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM246Q9BRR3 403 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 OR2B2Q9GZK3 357 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 IL22Q9GZX6 179 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RAB1BQ9H0U4 201 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM185BQ9H7F4 350 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NMUR1Q9HB89 426 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TIGARQ9NQ88 270 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 G6PC2Q9NQR9 355 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CTPS2Q9NRF8 586 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 POT1Q9NUX5 634 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MED17Q9NVC6 651 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PNPOQ9NVS9 261 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM248Q9NWD8 314 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CD274Q9NZQ7 290 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 STOML2Q9UJZ1 356 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 PLA2G4CQ9UP65 541 aa2.92□□□□□ -1.94
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PTPRM-204ENST00000577468 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LIPGQ9Y5X9 500 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CPQQ9Y646 472 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 KDM5BQ9UGL1 1544 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NCOA2Q15596 1464 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NUP155O75694 1391 aa2.91□□□□□ -1.94
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