RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568945.2

MKRN3-204, Transcript of makorin ring finger protein 3, human

TSL 4

Gene MKRN3, Length 2,740 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKRN3-204	ENST00000568945	INHBB	P09529	407 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	MAP2K4	P45985	399 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	HERVK_113	P63132	956 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	MRPS22	P82650	360 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SP2	Q02086	613 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	RING1	Q06587	406 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SYT9	Q86SS6	491 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	DTD2	Q96FN9	168 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	HHIP	Q96QV1	700 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ASCL2	Q99929	193 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	DPP3	Q9NY33	737 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ZNF282	Q9UDV7	671 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	MYH11	P35749	1972 aa		9.63	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GLOD5	A6NK44	160 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	WIPF1	O43516	503 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	KLK8	O60259	260 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CELA3A	P09093	270 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	STAG3L1	P0CL83	205 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	LBP	P18428	481 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GSTM3	P21266	225 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	OTX2	P32243	289 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CXCR3	P49682	368 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ACTR2	P61160	394 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ST8SIA6	P61647	398 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	DIP2A	Q14689	1571 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SLC17A1	Q14916	467 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	NTRK2	Q16620	822 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	PRAMEF13	Q5VWM6	474 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GPAT4	Q86UL3	456 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	RBFA	Q8N0V3	343 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ZHX1-C8orf76	Q96EF9	292 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	LRRC3	Q9BY71	257 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	FZD3	Q9NPG1	666 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ACSM4	P0C7M7	580 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	IFNGR1	P15260	489 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	FOSL2	P15408	326 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	LTBR	P36941	435 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	DLST	P36957	453 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	PLA2G16	P53816	162 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	PTPRCAP	Q14761	206 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	PCLAF	Q15004	111 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	TMED2	Q15363	201 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	RAB30	Q15771	203 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	LIPI	Q6XZB0	460 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CENPU	Q71F23	418 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ZNF410	Q86VK4	478 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GTF2H4	Q92759	462 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	OR14A2	Q96R54	314 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	TRIB1	Q96RU8	372 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	MRPS26	Q9BYN8	205 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	MARCH4	Q9P2E8	410 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SOX30	O94993	753 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	TK1	P04183	234 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	EPHX1	P07099	455 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	BGN	P21810	368 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	EPHA4	P54764	986 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	STX19	Q8N4C7	294 aa		9.62	□□□□□ -0.87
MKRN3-204	ENST00000568945	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		9.62	□□□□□ -0.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms