RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MUA0	341 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN4	O14493	209 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	NEURL1	O76050	574 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	MST1	P26927	711 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	PPP2R1B	P30154	601 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TGM3	Q08188	693 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	20.35	■□□□□ 0.85	9e-10	■□□□□ 8.1
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TEX9	Q8N6V9	391 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	C5orf34	Q96MH7	638 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	PAFAH2	Q99487	392 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	LYRM4	Q9HD34	91 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		20.35	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO1D	O94832	1006 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	INHBA	P08476	426 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	STS	P08842	583 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB1	P30740	379 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	MLF1	P58340	268 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC13A2	Q13183	592 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	C4orf17	Q53FE4	359 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	KLC3	Q6P597	504 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	HES7	Q9BYE0	225 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS11	Q9H270	941 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF358	Q9NW07	568 aa		20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	20.34	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		20.33	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	RTCA	O00442	366 aa	Known RBP	20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CTNS	O60931	367 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TGFB1	P01137	390 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GFAP	P14136	432 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PMP22	Q01453	160 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		20.33	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ASPDH	A6ND91	283 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRTM2	O43300	516 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	UGDH	O60701	494 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	WISP2	O76076	250 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SIX3	O95343	332 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PCNA	P12004	261 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PIK3CB	P42338	1070 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SERPINB9	P50453	376 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RCN2	Q14257	317 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPJ	Q5W064	366 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CHSY3	Q70JA7	882 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF175	Q8N4F7	328 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	KIF18A	Q8NI77	898 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL1	Q9NR64	748 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	PNO1	Q9NRX1	252 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	LRFN1	Q9P244	771 aa		20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200		H0YIV9	168 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SH3BGRL	O75368	114 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN1	O95832	211 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CD46	P15529	392 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CLCN2	P51788	898 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK10	P57789	538 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2H2	Q13888	395 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	OR51B5	Q9H339	312 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		20.31	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT38	O76015	456 aa		20.3	■□□□□ 0.84
PPP4C-205	ENST00000563200	SP1	P08047	785 aa		20.3	■□□□□ 0.84

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms