RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TTTY12Q9BZ98 90 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SLC24A3Q9HC58 644 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CLDN16Q9Y5I7 305 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 LRIT2A6NDA9 550 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 KLK8O60259 260 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZWINTO95229 277 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CNR1P21554 472 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ACVR2AP27037 513 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 GDF5P43026 501 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 HNMTP50135 292 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PLA2G16P53816 162 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 CDKL1Q00532 357 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 FRA10AC1Q70Z53 315 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 LRRC8AQ8IWT6 810 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 KRT78Q8N1N4 520 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 NRGNQ92686 78 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SMC6Q96SB8 1091 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 OARD1Q9Y530 152 aa15.77■□□□□ 0.12
CS-214ENST00000548849 SPG11Q96JI7 2443 aa15.77■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 A0A0G2JMM0 328 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PPB8 328 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 A0A1W2PRS3 328 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 FIGNL2A6NMB9 653 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 KIR3DP1A8MWS1 328 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 BCKDKO14874 412 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 TNNI3P19429 210 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ELK3P41970 407 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 GK5Q6ZS86 529 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 SCYL1Q96KG9 808 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 QRFPRQ96P65 431 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 FAM173AQ9BQD7 235 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 TTYH2Q9BSA4 534 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 PLAC1Q9HBJ0 212 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CHMP2BQ9UQN3 213 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 LIPGQ9Y5X9 500 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 MTORP42345 2549 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 DNAJC13O75165 2243 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 OR14I1A6ND48 311 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CTNSO60931 367 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CLEC3AO75596 197 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 GLSO94925 669 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CD99P14209 185 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CERS1P27544 350 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 MAGEA5P43359 124 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 HK2P52789 917 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 IST1P53990 364 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 LIM2P55344 173 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 STX4Q12846 297 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 RCN2Q14257 317 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ZNF460Q14592 562 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 RTL4Q6ZR62 310 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 FAM47EQ6ZV65 393 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 PDIK1LQ8N165 341 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 FAM109AQ8N4B1 249 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 TMEM251Q8N6I4 163 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ZNF321PQ8N8H1 164 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 MORN4Q8NDC4 146 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 OR2L5Q8NG80 312 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ACTRT1Q8TDG2 376 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ANKRD7Q92527 254 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 PWWP2AQ96N64 755 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 SERINC2Q96SA4 455 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CSF3RQ99062 836 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 OR8D2Q9GZM6 311 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 LDAHQ9H6V9 325 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 IL1RL2Q9HB29 575 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 VTI1BQ9UEU0 232 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ACAD8Q9UKU7 415 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 DAPP1Q9UN19 280 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 NF1P21359 2839 aa15.75■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.74■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa15.74■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CS-214ENST00000548849 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms