RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520898.5

UBR5-208, Transcript of ubiquitin protein ligase E3 component n-recognin 5, human

TSL 3

Gene UBR5, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBR5-208	ENST00000520898	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RBBP7	Q16576	425 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TAX1BP1	Q86VP1	789 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CEP97	Q8IW35	865 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ULK4	Q96C45	1275 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FCRL5	Q96RD9	977 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	HGH1	Q9BTY7	390 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CUTC	Q9NTM9	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898		A0A087X0T9	212 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR5H15	A6NDH6	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	C2orf81	A6NN90	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898		M0R3H8	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RAB27B	O00194	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ADAM10	O14672	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	BMP10	O95393	424 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	AP2A1	O95782	977 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	WDPCP	O95876	746 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	F10	P00742	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	AGT	P01019	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CELA2A	P08217	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FAM228B	P0C875	321 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RALB	P11234	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZFX	P17010	805 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MAG	P20916	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MCM3	P25205	808 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ADRA1A	P35348	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR1D4	P47884	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ZNF140	P52738	457 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CHN2	P52757	468 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ART1	P52961	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	ITGA8	P53708	1063 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CASP6	P55212	293 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CACNG1	Q06432	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MPP3	Q13368	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TAZ	Q16635	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SNX20	Q7Z614	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	GAS2L3	Q86XJ1	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	LINC01555	Q8NAE3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	OR14A2	Q96R54	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	COPS8	Q99627	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FICD	Q9BVA6	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	FAM96A	Q9H5X1	160 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBR5-208	ENST00000520898	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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