RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZP3P21754 424 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CTNNA2P26232 953 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TM4SF1P30408 202 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WSCD2Q2TBF2 565 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC22A10Q63ZE4 541 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NEPROQ6NW34 567 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TATDN1Q6P1N9 297 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CERS5Q8N5B7 392 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PLEKHF1Q96S99 279 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAFAH2Q99487 392 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBN1Q9NPG3 1134 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TXNDC16Q9P2K2 825 aa0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP0.49□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANHXE9PGG2 379 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KIF5CO60282 957 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV3-23P01764 117 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MT-ND2P03891 347 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF286BP0CG31 522 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD22P20273 847 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HERVK_113P61574 105 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CACNG1Q06432 222 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PAGE2BQ5JRK9 111 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CALHM3Q86XJ0 350 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRSS35Q8N3Z0 413 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARL14Q8N4G2 192 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF615Q8N8J6 731 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CLEC1AQ8NC01 280 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GUCD1Q96NT3 240 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPG21Q9NZD8 308 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDP2Q9P2J9 529 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GSRP00390 522 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HPNP05981 417 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GARSP41250 739 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ASCL1P50553 236 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CAV2P51636 162 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IRF3Q14653 427 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MICAQ29983 383 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LETM2Q2VYF4 491 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TCEAL6Q6IPX3 200 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF671Q8TAW3 534 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NXNL1Q96CM4 212 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PGM2Q96G03 612 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TTYH2Q9BSA4 534 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NT5DC2Q9H857 520 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MIEF1Q9NQG6 463 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF221Q9UK13 617 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF233A6NK53 670 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NPHP1O15259 732 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FGF19O95750 216 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINGO3P0C6S8 592 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOSL2P15408 326 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PFKFB1P16118 471 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CELP19835 753 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CD34P28906 385 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHRFAM7AQ494W8 412 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CBWD6Q4V339 395 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CBWD3Q5JTY5 395 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 COX8CQ7Z4L0 72 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PRUNE1Q86TP1 453 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANKRD42Q8N9B4 389 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP6NLQ92738 828 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ITPAQ9BY32 194 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MLXQ9UH92 298 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF229Q9UJW7 825 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRYL1Q9Y2S2 319 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC15A5A6NIM6 579 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 H3BMM5 538 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADAMDEC1O15204 470 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SBK2P0C263 348 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CCDC159P0C7I6 412 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PPP2R1BP30154 601 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ARL3P36405 182 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS10P46783 165 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms