RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CLIP4Q8N3C7 705 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 WDR34Q96EX3 536 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MYNNQ9NPC7 610 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CLN6Q9NWW5 311 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 FTSJ1Q9UET6 329 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DYRK1BQ9Y463 629 aa25.87■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 TYRP14679 529 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa25.85■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC6A16Q9GZN6 736 aa25.85■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 ARHGAP33O14559 1287 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 LILRB3O75022 631 aa25.85■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 DOC2BQ14184 412 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa25.85■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 IRF7Q92985 503 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 LINC00597Q9H2U6 94 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CTDSP2O14595 271 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 KMOO15229 486 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX4O95219 450 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CCR2P41597 374 aa25.84■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 PIK3CBP42338 1070 aa25.84■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC190Q86UF4 302 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MMP21Q8N119 569 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF740Q8NDX6 193 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SGPP1Q9BX95 441 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 IL3P08700 152 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SSX1Q16384 188 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 LEXMQ3ZCV2 418 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 UNC5DQ6UXZ4 953 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 LIPIQ6XZB0 460 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DPPA4Q7L190 304 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 MTERF3Q96E29 417 aa25.83■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 KCNS3Q9BQ31 491 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 DENND4CQ5VZ89 1909 aa25.83■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 LIM2P55344 173 aa25.83■■□□□ 1.73
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SH3BP2-221ENST00000511747 NOGQ13253 232 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM46DQ8NEK8 389 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC5A11Q8WWX8 675 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 CTRCQ99895 268 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-221ENST00000511747 TSPAN11A1L157 253 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 ARRDC5A6NEK1 342 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 DEFA1P59665 94 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 DEFA3P59666 94 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF805Q5CZA5 627 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 DEPDC1Q5TB30 811 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-221ENST00000511747 REEP3Q6NUK4 255 aa25.82■■□□□ 1.72
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