RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SNX7Q9UNH6 387 aa2.31□□□□□ -2.04
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM168BA1KXE4 195 aa2.3□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 A8MU76 341 aa2.3□□□□□ -2.04
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKRD2Q9GZV1 360 aa2.29□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C2orf40Q9H1Z8 148 aa2.29□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RABEP2Q9H5N1 569 aa2.29□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MTRRQ9UBK8 725 aa2.29□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NSG2Q9Y328 171 aa2.29□□□□□ -2.04
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SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DIAPH2O60879 1101 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBX10O75333 385 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TBCAO75347 108 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KBTBD11O94819 623 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VENTXO95231 258 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GOSR1O95249 250 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FGF19O95750 216 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BAG2O95816 211 aa2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 IGHDP01880 384 aa2.28□□□□□ -2.04
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