RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	TSLP	Q969D9	159 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	VMP1	Q96GC9	406 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM18	Q96H35	190 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ART5	Q96L15	291 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PELO	Q9BRX2	385 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MS4A8	Q9BY19	250 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OLAH	Q9NV23	265 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	LYAR	Q9NX58	379 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MID2	Q9UJV3	735 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		10.64	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	HMX2	A2RU54	273 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MUA0	341 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PRAMEF2	O60811	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CRCP	O75575	148 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MYO1D	O94832	1006 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	WDPCP	O95876	746 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GALT4	O96024	378 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MTHFD2	P13995	350 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	EDN3	P14138	238 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MAOA	P21397	527 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GNLY	P22749	145 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX11	P35716	441 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGEA12	P43365	314 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CYB561	P49447	251 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP6	P55212	293 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PER3	P56645	1201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	BTG2	P78543	158 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SLAMF1	Q13291	335 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CUL3	Q13618	768 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	NR6A1	Q15406	480 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	NUDT13	Q86X67	352 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM156	Q8N614	296 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ACOT4	Q8N9L9	421 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC63	Q8NA47	563 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246		Q8NA96	180 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OR5L2	Q8NGL0	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OR14A16	Q8NHC5	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PRR7	Q8TB68	274 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DGAT2	Q96PD7	388 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TBK1	Q9UHD2	729 aa		10.63	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GABRR3	A8MPY1	467 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BQF6	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	E2F3	O00716	465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GLRA3	O75311	464 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SH3BGRL	O75368	114 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZFAND5	O76080	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SUPT7L	O94864	414 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT6A	P02538	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT6B	P04259	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP5A1	P25705	553 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFRSF8	P28908	595 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GMPR	P36959	345 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	KRT6C	P48668	564 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PLIN5	Q00G26	463 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ASPH	Q12797	758 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	RUNX2	Q13950	521 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	E2F2	Q14209	437 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CFAP157	Q5JU67	520 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FRG2	Q64ET8	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR180	Q86V85	440 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FAR1	Q8WVX9	515 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	TANK	Q92844	425 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	GPR78	Q96P69	363 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	FRG2B	Q96QU4	278 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	NTMT1	Q9BV86	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	ALOXE3	Q9BYJ1	711 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	OR51B5	Q9H339	312 aa		10.62	□□□□□ -0.71
TTLL3-231	ENST00000496246	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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