RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 WDR20Q8TBZ3 569 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HM13Q8TCT9 377 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ATL1Q8WXF7 558 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GLMNQ92990 594 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAL2Q969L2 176 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PMEPA1Q969W9 287 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NUS1Q96E22 293 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCDC115Q96NT0 180 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DPH1Q9BZG8 443 aa6.71□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 AASSQ9UDR5 926 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 REV3LO60673 3130 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GABRR3A8MPY1 467 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MYO1DO94832 1006 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SOD1P00441 154 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CYP4B1P13584 511 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MPLP40238 635 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ALDH3B2P48448 385 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MC1RQ01726 317 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF234Q14588 700 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMEM52BQ4KMG9 183 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TTC23LQ6PF05 361 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GPR141Q7Z602 305 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C7orf57Q8NEG2 295 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 VPS37AQ8NEZ2 397 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR8D1Q8WZ84 308 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TESCQ96BS2 214 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MED30Q96HR3 178 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TPD52L3Q96J77 140 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MYOCQ99972 504 aa6.71□□□□□ -1.34
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HERC4-211ENST00000492996 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TMEM9BQ9NQ34 198 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DYRK4Q9NR20 520 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 UCKL1Q9NWZ5 548 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 VNN3Q9NY84 501 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CA14Q9ULX7 337 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PADI4Q9UM07 663 aa6.71□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ARHGAP33O14559 1287 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SCAMP1O15126 338 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 C1orf105O95561 183 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ONECUT2O95948 504 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EPHX1P07099 455 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ADRB3P13945 408 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CD27P26842 260 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 DCTP40126 519 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 WNT3P56703 355 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ABHD18Q0P651 414 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KCNAB2Q13303 367 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MEP1AQ16819 746 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CCDC58Q4VC31 144 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PERM1Q5SV97 790 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GPR107Q5VW38 600 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 YAF2Q8IY57 180 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KLK6Q92876 244 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SPNS1Q9H2V7 528 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 KLHL3Q9UH77 587 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF639Q9UID6 485 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ABCG2Q9UNQ0 655 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ASF1AQ9Y294 204 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GTQ1 180 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FAM220BPB1ANY3 271 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 QSOX1O00391 747 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SCN2BO60939 215 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 HNF4AP41235 474 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 GZMMP51124 257 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 PMS2P3Q13401 168 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 SHBQ15464 509 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 TCEA2Q15560 299 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CPTPQ5TA50 214 aa6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
HERC4-211ENST00000492996 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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