RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 SPANXN4Q5MJ08 99 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 WLSQ5T9L3 541 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZSR9 355 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 Q6ZVQ6 151 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 OR52E1Q8NGJ3 308 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KRT12Q99456 494 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 KRT23Q9C075 422 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HSD3B7Q9H2F3 369 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 HOMER3Q9NSC5 361 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRC-212ENST00000491302 MEIOCA2RUB1 952 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ECE2O60344 883 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MAGEC1O60732 1142 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NXPH2O95156 264 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 IGHEP01854 428 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ETS1P14921 441 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FCARP24071 287 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ACP1P24666 158 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR1D2P34982 312 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MEF2DQ14814 521 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 C3AR1Q16581 482 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP17Q68EM7 881 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 C17orf64Q86WR6 236 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CNNM3Q8NE01 707 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NEDD4P46934 1319 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 LMO7DNF2Z398 122 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NME2P1O60361 137 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ATP6P00846 226 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 GPR183P32249 361 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ASMTP46597 345 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 DRP2Q13474 957 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 HEPACAMQ14CZ8 416 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CUZD1Q86UP6 607 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF577Q9BSK1 485 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 SPASTQ9UBP0 616 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NARFQ9UHQ1 456 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR1A2Q9Y585 309 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RASGRF2O14827 1237 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR6A2O95222 327 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 AMBPP02760 352 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CXCL10P02778 98 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 SP1P08047 785 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CCNA2P20248 432 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 GEMP55040 296 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 HSPA14Q0VDF9 509 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 NKAIN2Q5VXU1 208 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 C1orf186Q6ZWK4 172 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR6M1Q8NGM8 313 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TBC1D31Q96DN5 1066 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK16Q96T55 309 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 AGPAT1Q99943 283 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ATG10Q9H0Y0 220 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 IKBKBO14920 756 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 LRCH4O75427 683 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 PITPNBP48739 271 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 BTG1P62324 171 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 HERV-K104P63124 156 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 OR1C1Q15619 314 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 CARTPTQ16568 116 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 MPPE1Q53F39 396 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 ADCK1Q86TW2 530 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRC-212ENST00000491302 TAF4BQ92750 862 aa6.61□□□□□ -1.35
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