RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DMRT3Q9NQL9 472 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MS4A12Q9NXJ0 267 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa25.16■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SAGE2PA6NJ88 616 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SMIM23A6NLE4 172 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 GOLGA8RI6L899 631 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 TNNI3P19429 210 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ACER2Q5QJU3 275 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP20A1Q6UW02 462 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 FAM180AQ6UWF9 173 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC22A9Q8IVM8 553 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CATSPER1Q8NEC5 780 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 DEFB126Q9BYW3 111 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF32Q9H0A6 362 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ELOVL6Q9H5J4 265 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 AHSPQ9NZD4 102 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PCTPQ9UKL6 214 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXW2Q9UKT8 454 aa25.15■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 RTCAO00442 366 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CTNSO60931 367 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 WDPCPO95876 746 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PYGBP11216 843 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 GCAP28676 217 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 RPS13P62277 151 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SLAMF1Q13291 335 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CDK15Q96Q40 435 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 SERPINI1Q99574 410 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 NTMT1Q9BV86 223 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 WDR41Q9HAD4 459 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 PHF11Q9UIL8 331 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CSAG2Q9Y5P2 127 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa25.14■■□□□ 1.62
CCZ1B-211ENST00000486840 OR5H15A6NDH6 313 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 DYRK3O43781 588 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 MYO1DO94832 1006 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 F10P00742 488 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CCT5P48643 541 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TNFSF10P50591 281 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ARFIP1P53367 373 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SERTAD2Q14140 314 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 FCRLBQ6BAA4 426 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CLNKQ7Z7G1 428 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ASF1BQ9NVP2 202 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 NMRK1Q9NWW6 199 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM216Q9P0N5 145 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX6Q9UNH7 406 aa25.13■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGAP10A1A4S6 786 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 A8MT66 165 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 FCHO1O14526 889 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 OR7A17O14581 309 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SUPT7LO94864 414 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 COX7A2P14406 83 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SLCO1A2P46721 670 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CLCN2P51788 898 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CUL3Q13618 768 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 FRG2Q64ET8 278 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 C19orf60Q96EN9 201 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 FRG2BQ96QU4 278 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ADAP2Q9NPF8 381 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 STK38LQ9Y2H1 464 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 BSNQ9UPA5 3926 aa25.12■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 GLRA3O75311 464 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 GNLYP22749 145 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 PPP2R1BP30154 601 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 NEK2P51955 445 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 HERVK_113P63132 956 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 TERF2Q15554 542 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SGO1Q5FBB7 561 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 H3F3CQ6NXT2 135 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 UBE3DQ7Z6J8 389 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 GPR180Q86V85 440 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 SCUBE1Q8IWY4 988 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC63Q8NA47 563 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 OR52B6Q8NGF0 335 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC126Q96EE4 140 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ERVK-6Q9BXR3 956 aa25.11■■□□□ 1.61
CCZ1B-211ENST00000486840 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa25.11■■□□□ 1.61
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