RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 PLA2G4CQ9UP65 541 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 NUDCQ9Y266 331 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ATP8B3O60423 1300 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF123Q5XPI4 1314 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM205AQ6ZU69 1335 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 KPNA7A9QM74 516 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM72CH0Y354 149 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CCSO14618 274 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CHEK1O14757 476 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 KCNAB3O43448 404 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SOCS5O75159 536 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 GUCA1CO95843 209 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 AKT2P31751 481 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ALDH3B1P43353 468 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 DPYSQ14117 519 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SPANXN4Q5MJ08 99 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 STPG1Q5TH74 334 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM72AQ5TYM5 149 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM72DQ6L9T8 149 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 IRGCQ6NXR0 463 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 UNC5DQ6UXZ4 953 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SYVN1Q86TM6 617 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM72BQ86X60 149 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ZBTB44Q8NCP5 570 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CCDC197Q8NCU1 140 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 OR56B1Q8NGI3 324 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB39BQ96DA2 213 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 COQ7Q99807 217 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 AGPAT1Q99943 283 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FUCA2Q9BTY2 467 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB17Q9H0T7 212 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 COPS7AQ9UBW8 275 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1A2Q9Y585 309 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ARID2Q68CP9 1835 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0U1RRA0 63 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 LMO7DNF2Z398 122 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 K7EPI3 171 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 NDC80O14777 642 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SURF4O15260 269 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ECE2O60344 883 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FGF19O95750 216 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 HEXBP07686 556 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 HMBSP08397 361 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 TPBGLP0DKB5 382 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CEACAM1P13688 526 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 C4BPBP20851 252 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJB1P25685 340 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 GIFP27352 417 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 KIF5BP33176 963 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP2K2P36507 400 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SOX3P41225 446 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CCL11P51671 97 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 XGP55808 180 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 OR1C1Q15619 314 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CARTPTQ16568 116 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 Q6ZVQ6 151 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf64Q86WR6 236 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC22A15Q8IZD6 547 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RAB42Q8N4Z0 105 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF148Q8N7C7 305 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 OR6S1Q8NH40 331 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4L1Q8NH43 312 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPK15Q8TD08 544 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ARHGAP45Q92619 1136 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 AZIN2Q96A70 460 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 C3orf14Q9HBI5 128 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 BLOC1S6Q9UL45 172 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 NEDD4P46934 1319 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGGTB-207ENST00000470201 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms