RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448984.1

TRIM49C-201, Transcript of tripartite motif containing 49C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM49C, Length 2,163 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49C-201ENST00000448984 TPH1P17752 444 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ERCC2P18074 760 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 FPR1P21462 350 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 DNASE1P24855 282 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 HOXA9P31269 272 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SPAM1P38567 509 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PNPLA4P41247 253 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SLC19A1P41440 591 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PGDP52209 483 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CAPZA1P52907 286 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 DAOAP59103 153 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PRKG2Q13237 762 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 TSTQ16762 297 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CD300LGQ6UXG3 332 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 DLEU7Q6UYE1 221 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 DET1Q7L5Y6 550 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 BHLHA9Q7RTU4 235 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 KDELC2Q7Z4H8 507 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PAQR7Q86WK9 346 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 MIB1Q86YT6 1006 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CNTN4Q8IWV2 1026 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZNF567Q8N184 647 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PNPLA1Q8N8W4 532 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 DMBX1Q8NFW5 382 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 OR2T12Q8NG77 320 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 USP7Q93009 1102 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 FAM162AQ96A26 154 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 MTERF3Q96E29 417 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 OR2M2Q96R28 347 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 GABARAPL3Q9BY60 117 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CASS4Q9NQ75 786 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 RNF186Q9NXI6 227 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 DUX4Q9UBX2 424 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 POLG2Q9UHN1 485 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZNF222Q9UK12 451 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SLC6A5Q9Y345 797 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CDH23Q9H251 3354 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 NEMP2A6NFY4 417 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 C9JVG2 144 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ARNTLO00327 626 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SULT1C2O00338 296 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 AZIN1O14977 448 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ADAM12O43184 909 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 OR4F21O95013 312 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 AP2A1O95782 977 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 GLUD1P00367 558 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 IL1AP01583 271 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 RLN2P04090 185 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 NMBP08949 121 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZNF806P0C7X5 589 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 HGFP14210 728 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SPI1P17947 270 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ITGB7P26010 798 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 NOS2P35228 1153 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PXNP49023 591 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 HNMTP50135 292 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PPP3R1P63098 170 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CDC42EP1Q00587 391 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SREBF2Q12772 1141 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 TRAM2Q15035 370 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CHRNA6Q15825 494 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 UPP1Q16831 310 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 MPEG1Q2M385 716 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZNF678Q5SXM1 525 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SUSD1Q6UWL2 747 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 C3P1Q6ZMU1 363 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SERINC5Q86VE9 423 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZFAND4Q86XD8 727 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZNF280BQ86YH2 543 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 SLC34A3Q8N130 599 aa7.19□□□□□ -1.26
TRIM49C-201ENST00000448984 STPG2Q8N412 459 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms