RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 KELP23276 732 aa15.28■□□□□ 0.04
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SHQ1-202ENST00000444040 TMEM245Q9H330 911 aa15.28■□□□□ 0.04
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SHQ1-202ENST00000444040 UBE3AQ05086 875 aa15.25■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 REEP3Q6NUK4 255 aa15.25■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 CEACAM20Q6UY09 585 aa15.25■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa15.25■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.25■□□□□ 0.03
SHQ1-202ENST00000444040 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.25■□□□□ 0.03
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