RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	MLF1	P58340	268 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LAPTM5	Q13571	262 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SLMAP	Q14BN4	828 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX31	Q8N9S9	440 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SERINC2	Q96SA4	455 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	KLHL1	Q9NR64	748 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC18	Q9NUE0	388 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LRFN1	Q9P244	771 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	DAPP1	Q9UN19	280 aa		16.56	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF3C1	Q12789	2109 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ESYT3	A0FGR9	886 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HMX2	A2RU54	273 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738		A8MUA0	341 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	KERA	O60938	352 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SP1	P08047	785 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MTHFD2	P13995	350 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	AGA	P20933	346 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TRHR	P34981	398 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR143	P51810	404 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MTTP	P55157	894 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP6	P55212	293 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LIM2	P55344	173 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC7A5	Q01650	507 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	IRF8	Q02556	426 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CHIT1	Q13231	466 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	RAPH1	Q70E73	1250 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	GALNTL5	Q7Z4T8	443 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF595	Q8IYB9	648 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	EXT2	Q93063	718 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	FRMD6	Q96NE9	622 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A8	Q9BY19	250 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	16.55	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	UBXN8	O00124	270 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MYO1D	O94832	1006 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CERS1	P27544	350 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SSTR2	P30874	369 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CLCN2	P51788	898 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ADORA2A-AS1	P86434	159 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	C8orf74	Q6P047	294 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF793	Q6ZN11	406 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LAS2	Q8IYD9	372 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM47B	Q8NA70	645 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NXNL1	Q96CM4	212 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR137	Q96N19	417 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CSF3R	Q99062	836 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ACOT9	Q9Y305	439 aa		16.54	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC189	A1A4V9	331 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738		K7EPI3	171 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CLDN4	O14493	209 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NME2P1	O60361	137 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC19A2	O60779	497 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC25A12	O75746	678 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPN3	P20807	821 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NME2	P22392	152 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP2R1B	P30154	601 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CYB561	P49447	251 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SMS	P52788	366 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SIAH3	Q8IW03	269 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2E3	Q969T4	207 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	VMP1	Q96GC9	406 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNC2	Q96PR1	638 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	F2RL3	Q96RI0	385 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ADAP2	Q9NPF8	381 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		16.53	■□□□□ 0.24
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A087X1B8	175 aa		16.52	■□□□□ 0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms