RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF24P17028 368 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 NTF4P34130 210 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SLC1A2P43004 574 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 MAGEA6P43360 314 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 VPS41P49754 854 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 MEOX1P50221 254 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PGGT1BP53609 377 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ITGA8P53708 1063 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 GNG11P61952 73 aa6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 MEI1Q5TIA1 1274 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 MCOLN3Q8TDD5 553 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF223Q9UK11 482 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 NF1P21359 2839 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa6.1□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 PINLYPA6NC86 204 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 A8MUA0 341 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 AP3B1O00203 1094 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 HLCSP50747 726 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CDK16Q00536 496 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 PHKG1Q16816 387 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TTLL9Q3SXZ7 439 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 DEFB134Q4QY38 66 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TTC27Q6P3X3 843 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LCTLQ6UWM7 567 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 C4orf22Q6V702 233 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 C17orf64Q86WR6 236 aa6.1□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.1□□□□□ -1.43
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HOXD8-202ENST00000429017 OR1F2PQ96R84 312 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 NDNQ99608 321 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 LZTFL1Q9NQ48 299 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 DEPPQ9NTK1 212 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 IKZF3Q9UKT9 509 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 MTORP42345 2549 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.1□□□□□ -1.43
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.1□□□□□ -1.43
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