RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SVOPLQ8N434 492 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR10G6Q8NH81 332 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KLF15Q9UIH9 416 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.06■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SEMG1P04279 462 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.123e-10■□□□□ 10.6
FAAP20-209ENST00000428120 APOFQ13790 326 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SCARB2Q14108 478 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA0895LQ68EN5 471 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 METTL25Q8N6Q8 603 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OSBPL10Q9BXB5 764 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 NLNQ9BYT8 704 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ADAM29Q9UKF5 820 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SCN3AQ9NY46 2000 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR6B1O95007 311 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PTGER1P34995 402 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CDH15P55291 814 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R2BQ00005 443 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 GPR18Q14330 331 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF425Q6IV72 752 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM48Q8IWZ4 208 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TSPAN14Q8NG11 270 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR5K1Q8NHB7 308 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KLHL25Q9H0H3 589 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TOR3AQ9H497 397 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CD320Q9NPF0 282 aa22.05■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 LRP4O75096 1905 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 LAMA1P25391 3075 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SUV39H1O43463 412 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 HS6ST1O60243 411 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TNFRSF1BP20333 461 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PAX7P23759 505 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 RABIFP47224 123 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TEAD4Q15561 434 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM35AQ53FP2 167 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR2T5Q6IEZ7 315 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR2T29Q8NH02 315 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa22.04■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 UQCRC2P22695 453 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 AHRP35869 848 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 FADDQ13158 208 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SLAMF1Q13291 335 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 GAS6Q14393 721 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CEP68Q76N32 757 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ACOT4Q8N9L9 421 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 MUS81Q96NY9 551 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 BAG5Q9UL15 447 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 SNX7Q9UNH6 387 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 GSAPA4D1B5 854 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ZW10O43264 779 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KRT75O95678 551 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 MAGP20916 626 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CERS1P27544 350 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CDK9P50750 372 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 ADPRMQ3LIE5 342 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KCNC2Q96PR1 638 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 FAM192AQ9GZU8 254 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PRDM7Q9NQW5 492 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 FBXW2Q9UKT8 454 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 PADI4Q9UM07 663 aa22.03■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 C10orf142B7Z368 130 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 HPRP00739 348 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 KCNJ10P78508 379 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CDK6Q00534 326 aa22.02■■□□□ 1.12
FAAP20-209ENST00000428120 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms