RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397023.5

PPARG-208, Transcript of peroxisome proliferator activated receptor gamma, human

TSL 5

Gene PPARG, Length 2,002 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARG-208	ENST00000397023	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MYL12A	P19105	171 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	AQP1	P29972	269 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CA8	P35219	290 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	SOX3	P41225	446 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GSTM5	P46439	218 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ARF5	P84085	180 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	IRF8	Q02556	426 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CHIT1	Q13231	466 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	TP53BP2	Q13625	1128 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	NDUFA9	Q16795	377 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	BTBD16	Q32M84	506 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	RNF219	Q5W0B1	726 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	C12orf73	Q69YU5	71 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MZT2A	Q6P582	158 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	LAS2	Q8IYD9	372 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	NAGS	Q8N159	534 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	LINC00471	Q8N535	108 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	OR52J3	Q8NH60	311 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ASB11	Q8WXH4	323 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	C11orf24	Q96F05	449 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	SMIM14	Q96QK8	99 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CITED4	Q96RK1	184 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	NELL2	Q99435	816 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	FOLH1B	Q9HBA9	442 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ATP6V1H	Q9UI12	483 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		9.24	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023		A0A0G2JMP0	313 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023		H3BM21	787 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	SGK494	L7N484	410 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	FAAH	O00519	579 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	SLC30A4	O14863	429 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GPR39	O43194	453 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ENTPD6	O75354	484 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CTSH	P09668	335 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	NUDT7	P0C024	238 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GPC1	P35052	558 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MAPK9	P45984	424 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CSNK1D	P48730	415 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	BTG1	P62324	171 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CDK6	Q00534	326 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	DSC1	Q08554	894 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MAP2K5	Q13163	448 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	HEPACAM	Q14CZ8	416 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	DUSP6	Q16828	381 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PLK5	Q496M5	336 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	KLHL22	Q53GT1	634 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	TMEM163	Q8TC26	289 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GTPBP3	Q969Y2	492 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	EID2B	Q96D98	161 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PTPN18	Q99952	460 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	ALG5	Q9Y673	324 aa		9.23	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023		A0A0B4J293	547 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	LINC00862	A6NCI5	91 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GABRR3	A8MPY1	467 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	GFY	I3L273	518 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PLA2G10	O15496	165 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	PCDH7	O60245	1069 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	TSPAN3	O60637	253 aa		9.22	□□□□□ -0.93
PPARG-208	ENST00000397023	AP2A2	O94973	939 aa		9.22	□□□□□ -0.93

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