RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 ST13P50502 369 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 PCDH1Q08174 1060 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 STX4Q12846 297 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 E2F2Q14209 437 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 TERF2Q15554 542 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 LIPJQ5W064 366 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 B3GNT7Q8NFL0 401 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 NR4A3Q92570 626 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 GPR78Q96P69 363 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 TAAR6Q96RI8 345 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 LYRM4Q9HD34 91 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 PRDM7Q9NQW5 492 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 KLHL1Q9NR64 748 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 OSGIN2Q9Y236 505 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 SAP18O00422 153 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 FCHO1O14526 889 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 MAN1A2O60476 641 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 SMIM24O75264 130 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 CLCN2P51788 898 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 GTF2H2Q13888 395 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.853e-8■■■■■ 31.3
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NME4-202ENST00000382940 LGSNQ5TDP6 509 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 ACOT4Q8N9L9 421 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 TMEM178AQ8NBL3 297 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 TMEM52Q8NDY8 209 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 DNAJB8Q8NHS0 232 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 ATP6V1E2Q96A05 226 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 CSF3RQ99062 836 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 NPAS2Q99743 824 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 CCDC77Q9BR77 488 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 OR51B5Q9H339 312 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 IPPKQ9H8X2 491 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 TMCO1Q9UM00 188 aa20.33■□□□□ 0.85
NME4-202ENST00000382940 ESPL1Q14674 2120 aa20.33■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 TRIM49D1C9J1S8 452 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 RTCAO00442 366 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 CYR61O00622 381 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 KLK8O60259 260 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 UGDHO60701 494 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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NME4-202ENST00000382940 UBE3DQ7Z6J8 389 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 HUS1BQ8NHY5 278 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 ISL2Q96A47 359 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 RGMAQ96B86 450 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 PHF21BQ96EK2 531 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 ADAP2Q9NPF8 381 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 ZNF358Q9NW07 568 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 LRFN1Q9P244 771 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 FBXW2Q9UKT8 454 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.32■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 CDK2AP1O14519 115 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 CTNSO60931 367 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 RHOXF2BP0C7M4 288 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 COL6A2P12110 1019 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 PPP2R1BP30154 601 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 MAGEA12P43365 314 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 CYB561P49447 251 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 GFRALQ6UXV0 394 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 ZNF793Q6ZN11 406 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 MDS2Q8NDY4 140 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 DCAKDQ8WVC6 231 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 VMP1Q96GC9 406 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 RHOXF2Q9BQY4 288 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 DMRT3Q9NQL9 472 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 XPR1Q9UBH6 696 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa20.31■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 MLYCDO95822 493 aa20.3■□□□□ 0.84
NME4-202ENST00000382940 TNNI3P19429 210 aa20.3■□□□□ 0.84
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