RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 CD300CQ08708 224 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PDE7AQ13946 482 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 NFE2L1Q14494 772 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CADM3Q8N126 398 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC5A8Q8N695 610 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 OR52N2Q8NGI0 321 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 DTD2Q96FN9 168 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM245Q9H330 911 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa17.94■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 KLHL18O94889 574 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDH8O95206 1070 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 OPN1SWP03999 348 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 GBAP04062 536 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 FURINP09958 794 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 MPEG1Q2M385 716 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 YAF2Q8IY57 180 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SYTL1Q8IYJ3 562 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RHOXF1Q8NHV9 184 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 NUS1Q96E22 293 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 IL17FQ96PD4 163 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC35A5Q9BS91 424 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SGPP1Q9BX95 441 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 DMRT3Q9NQL9 472 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 DYRK4Q9NR20 520 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PRAMEF25A6NGN4 478 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 IGLON5A6NGN9 336 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C6orf47O95873 294 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 MC1RQ01726 317 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RBBP4Q09028 425 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 FCHO2Q0JRZ9 810 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 IFI44LQ53G44 452 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM31Q5JXX7 168 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 GCNT6Q5T4J0 391 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 P3H2Q8IVL5 708 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 COPS4Q9BT78 406 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB11Q9BUY7 163 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ACAT2Q9BWD1 397 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EPS8L2Q9H6S3 715 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C1GALT1Q9NS00 363 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1A2Q9Y585 309 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 LILRB5O75023 590 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC80Q76M96 950 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF547Q8IVP9 402 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10G2Q8NGC3 310 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR48Q8TAF3 677 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 FCGR1BQ92637 280 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ITPAQ9BY32 194 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM38AQ9H6F2 299 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKHQ9HCJ1 492 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RLIMQ9NVW2 624 aa17.93■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR37L1O60883 481 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1E2P47887 323 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SCARB2Q14108 478 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 STARD3Q14849 445 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1211LQ6NV74 962 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 RTL10Q7L3V2 364 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PAGE2Q7Z2X7 111 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC38A4Q969I6 547 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 COQ10AQ96MF6 247 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 THSD1Q9NS62 852 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 FKBP14Q9NWM8 211 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PP55 124 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PIPSLA2A3N6 862 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 TGFB1P01137 390 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ANXA8P13928 327 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 ELP6Q0PNE2 266 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 INAVAQ3KP66 663 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 BCL7AQ4VC05 210 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM71E1Q6IPT2 247 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 CCDC103Q8IW40 242 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 KIAA1958Q8N8K9 716 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 NFKBIDQ8NI38 313 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 C16orf78Q8WTQ4 265 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EHD1Q9H4M9 534 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 DYRK1BQ9Y463 629 aa17.92■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 EFCAB9A8MZ26 197 aa17.91■□□□□ 0.46
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMD11O00231 422 aa17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms