RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MC2RQ01718 297 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPTPQ5TA50 214 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 HES3Q5TGS1 186 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPCDCQ96CD2 204 aa25.97■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTERF3Q96E29 417 aa25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3BP4Q9P0V3 963 aa25.97■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RDH16O75452 317 aa25.96■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CPN2P22792 545 aa25.96■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS26BQ4G0F5 336 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 SPANXN4Q5MJ08 99 aa25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BBIP1A8MTZ0 92 aa25.95■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DSCR3O14972 297 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SCRG1O75711 98 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 MED26O95402 600 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 HBQ1P09105 142 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 FURINP09958 794 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF5P12034 268 aa25.95■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TIGD2Q4W5G0 525 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR7A2PQ8NGA2 310 aa25.95■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC39A1Q9NY26 324 aa25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDUFAF1Q9Y375 327 aa25.95■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PP18 115 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf226A1L170 272 aa25.94■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 B4E171 279 aa25.94■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MXRA7P84157 204 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRMT9Q6P2P2 845 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAB11FIP2Q7L804 512 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 DSELQ8IZU8 1212 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 BMPERQ8N8U9 685 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 VPS33AQ96AX1 596 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52E6Q96RD3 313 aa25.94■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A1W2PR48 441 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC30A4O14863 429 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL4P13236 92 aa25.93■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CPA2P48052 419 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN6P56747 220 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 TNFRSF17Q02223 184 aa25.93■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CA13Q8N1Q1 262 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5T3Q8NGG3 340 aa25.93■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CTRCQ99895 268 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 EFCAB1Q9HAE3 211 aa25.93■■□□□ 1.74
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KCMF1Q9P0J7 381 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAMTS20P59510 1910 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 TM4SF5O14894 197 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 CHST10O43529 356 aa25.93■■□□□ 1.74
CTDNEP1-201ENST00000318988 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
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