RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299578.9

C16orf46-201, Transcript of chromosome 16 open reading frame 46, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene C16orf46, Length 1,605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf46-201ENST00000299578 ACSL6Q9UKU0 697 aa11.34□□□□□ -0.59
C16orf46-201ENST00000299578 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa11.34□□□□□ -0.59
C16orf46-201ENST00000299578 FITM1A5D6W6 292 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CCDC154A6NI56 674 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TXNDC9O14530 226 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 P2RX6O15547 441 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 UGDHO60701 494 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 EEDO75530 441 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 STATHP02808 62 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NTRK1P04629 796 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HSD17B1P14061 328 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 AHRP35869 848 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LAPTM5Q13571 262 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 E2F2Q14209 437 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GRM7Q14831 915 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HKDC1Q2TB90 917 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 IZUMO2Q6UXV1 221 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 RNF111Q6ZNA4 994 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM46Q7Z4K8 759 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ASPGQ86U10 573 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 RETREG3Q86VR2 466 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ZFAND4Q86XD8 727 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 RNF148Q8N7C7 305 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ANKRD53Q8N9V6 530 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LRRC58Q96CX6 371 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CLIP3Q96DZ5 547 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NDC1Q9BTX1 674 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ENAMQ9NRM1 1142 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SRPK3Q9UPE1 567 aa11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PRORSD1PA6NEY8 169 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LSM1O15116 133 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NDUFS4O43181 175 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ULK1O75385 1050 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CLDN9O95484 217 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 DLGAP3O95886 979 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 KRT6AP02538 564 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 KRT6BP04259 564 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SERPIND1P05546 499 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 C8BP07358 591 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HBQ1P09105 142 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SLC35G6P0C7Q6 338 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HNF4AP41235 474 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 KRT6CP48668 564 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SLC7A2P52569 658 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NME5P56597 212 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CYP4F2P78329 520 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 RHDQ02161 417 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 KLC1Q07866 573 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 BNIP2Q12982 314 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NR6A1Q15406 480 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 AP5B1Q2VPB7 878 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GGTA1PQ4G0N0 100 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LIPJQ5W064 366 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 FAM219BQ5XKK7 198 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GRHL2Q6ISB3 625 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SCIMPQ6UWF3 145 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ARPINQ7Z6K5 226 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SPATA24Q86W54 205 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GOLM1Q8NBJ4 401 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GALNT6Q8NCL4 622 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TTLQ8NG68 377 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 FGF11Q92914 225 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 UBE2E3Q969T4 207 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LRGUKQ96M69 825 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 EFHD1Q9BUP0 239 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SPRY4Q9C004 299 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TRIM15Q9C019 465 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MUC13Q9H3R2 512 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 NT5DC2Q9H857 520 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CUTCQ9NTM9 273 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 ASIC5Q9NY37 505 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.32□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 HYKKA2RU49 373 aa11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 LIPCP11150 499 aa11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 GSTM2P28161 218 aa11.31□□□□□ -0.6
C16orf46-201ENST00000299578 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms