RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 SDC1P18827 310 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 EIPR1Q53HC9 387 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ZNF613Q6PF04 617 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 DCDC5Q6ZRR9 648 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TOMM5Q8N4H5 51 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 LINC00471Q8N535 108 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 METTL25Q8N6Q8 603 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CRHBPP24387 322 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PGDP52209 483 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ERVK-21P61565 698 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 OR8J1Q8NGP2 316 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 IRF7Q92985 503 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 F2RL3Q96RI0 385 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 WASH4PA8MWX3 477 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 E7EQ34 232 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CD9P21926 228 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ALAS2P22557 587 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ARPC4P59998 168 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PTPRRQ15256 657 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 XKR8Q9H6D3 395 aa20.87■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CLDN4O14493 209 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 MPC1LP0DKB6 136 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 UQCRC2P22695 453 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CD70P32970 193 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 UGT8Q16880 541 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ZNF181Q2M3W8 571 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TAF8Q7Z7C8 310 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 OR9Q2Q8NGE9 314 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 GTF2H4Q92759 462 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 KRBA1A5PL33 1030 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ARNTLO00327 626 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 HSD3B1P14060 373 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 HSD3B2P26439 372 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CNR2P34972 360 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TGFBR2P37173 567 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SPINT3P49223 89 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PROX2Q3B8N5 592 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SH2D5Q6ZV89 423 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ANXA2P2A6NMY6 339 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 M0R129 80 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 REM1O75628 298 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CLLU1OSQ5K130 101 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ZFP41Q8N8Y5 198 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 HERVK_113Q902F9 699 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SCRN2Q96FV2 425 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 MCHR1Q99705 422 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 BTBD1Q9H0C5 482 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SMURF1Q9HCE7 757 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 WDR45Q9Y484 360 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TFPIP10646 304 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SHMT2P34897 504 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 GRK6P43250 576 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 MAB21L1Q13394 359 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PRSS58Q8IYP2 241 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 DTX3Q8N9I9 347 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 C5orf34Q96MH7 638 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 RETREG1Q9H6L5 497 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 STOML2Q9UJZ1 356 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.86■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 RAB36O95755 333 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ECDO95905 644 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TOMM20Q15388 145 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SLC27A4Q6P1M0 643 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 LRRC20Q8TCA0 184 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 LRR1Q96L50 414 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 GAL3ST4Q96RP7 486 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ACPTQ9BZG2 426 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 HEBP1Q9NRV9 189 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 CKLFQ9UBR5 152 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 PFDN2Q9UHV9 154 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ENPP5Q9UJA9 477 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 AOC2O75106 756 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ACVR2AP27037 513 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 ADAM15Q13444 863 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 C6orf120Q7Z4R8 191 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TMEM246Q9BRR3 403 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 BRD7Q9NPI1 651 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 TRIM36Q9NQ86 728 aa20.85■□□□□ 0.93
USP12-201ENST00000282344 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms