RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000276410.6

CHRNA6-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 6 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA6, Length 2,400 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6-201ENST00000276410 ZFP69Q49AA0 526 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 GCNT6Q5T4J0 391 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 AGTRAPQ6RW13 159 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 TPRG1Q6ZUI0 275 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 Q6ZVU0 165 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 SLC34A3Q8N130 599 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.5□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 SLC6A18Q96N87 628 aa9.5□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 OR51B5Q9H339 312 aa9.5□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 ARMC4Q5T2S8 1044 aa9.5□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 IL7P13232 177 aa9.49□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 SPINT3P49223 89 aa9.49□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 CDC42P60953 191 aa9.49□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.49□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa9.49□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
CHRNA6-201ENST00000276410 MEIOCA2RUB1 952 aa9.48□□□□□ -0.89
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CHRNA6-201ENST00000276410 LEFTY2O00292 366 aa9.48□□□□□ -0.89
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