RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271628.8

SF3B4-201, Transcript of splicing factor 3b subunit 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SF3B4, Length 2,085 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4-201ENST00000271628 ALBP02768 609 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 BCL6P41182 706 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SSR2P43308 183 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ALDH3A2P51648 485 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GAB1Q13480 694 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TRIM40Q6P9F5 258 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TRIM48Q8IWZ4 208 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SDCCAG3Q96C92 435 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CHST8Q9H2A9 424 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NTN4Q9HB63 628 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 A0A1W2PPC4 97 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 HAT1O14929 419 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KRT75O95678 551 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CLIC3O95833 236 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 DRD2P14416 443 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 DCKP27707 260 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CRATP43155 626 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 HLCSP50747 726 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PLA2G16P53816 162 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 VAC14Q08AM6 782 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RBBP4Q09028 425 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MYBPC3Q14896 1274 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TCEA2Q15560 299 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MFSD9Q8NBP5 474 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 C11orf65Q8NCR3 313 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RDH12Q96NR8 316 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 KCNC2Q96PR1 638 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GALNT8Q9NY28 637 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CA14Q9ULX7 337 aa14.57□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 UPK1AO00322 258 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GUCY1B2O75343 617 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 VIPP01282 170 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 THEGLP0DJG4 465 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 UQCRC2P22695 453 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ALDH9A1P49189 494 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 BLKP51451 505 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ARSFP54793 590 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SLC9A5Q14940 896 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PLCL1Q15111 1095 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 LEXMQ3ZCV2 418 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CBLL1Q75N03 491 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FAM20CQ8IXL6 584 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 OFCC1Q8IZS5 231 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NAGSQ8N159 534 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SVOPLQ8N434 492 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 OR5P2Q8WZ92 322 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TMBIM1Q969X1 311 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 C17orf62Q9BQA9 187 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NEUROD4Q9HD90 331 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 POT1Q9NUX5 634 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 LRP4O75096 1905 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 A0A0A6YYD5 115 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 G3V2T6 193 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 BTN3A3O00478 584 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PDPK1O15530 556 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TMPRSS11DO60235 418 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 ZNF682O95780 498 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 HPRP00739 348 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 C1QCP02747 245 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PCGF2P35227 344 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MAGEA2P43356 314 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PMS2P3Q13401 168 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 DAG1Q14118 895 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NKG7Q16617 165 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 OR2L5Q8NG80 312 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 SHDQ96IW2 340 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 NLNQ9BYT8 704 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TWSG1Q9GZX9 223 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 GPR27Q9NS67 375 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 EHD3Q9NZN3 535 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.56□□□□□ -0.08
SF3B4-201ENST00000271628 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms